More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14151 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 
330 aa  678    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  46.93 
 
 
328 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  47.2 
 
 
324 aa  305  9.000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  43.96 
 
 
329 aa  299  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 
328 aa  297  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  44.65 
 
 
328 aa  297  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  44.24 
 
 
328 aa  297  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  43.57 
 
 
330 aa  296  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  45.25 
 
 
330 aa  295  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 
327 aa  295  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  44.79 
 
 
354 aa  295  5e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 
327 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  45.25 
 
 
330 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 
328 aa  294  1e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  42.41 
 
 
329 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 
327 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  42.32 
 
 
334 aa  292  6e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  43.89 
 
 
328 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  44.17 
 
 
327 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  44.86 
 
 
328 aa  288  9e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 
332 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  44.69 
 
 
321 aa  286  4e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  42.06 
 
 
329 aa  286  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  44.03 
 
 
331 aa  285  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  43.56 
 
 
329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  44.3 
 
 
330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  45.94 
 
 
324 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 
333 aa  281  8.000000000000001e-75  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  42.99 
 
 
330 aa  281  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  45 
 
 
326 aa  281  1e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  44.2 
 
 
324 aa  280  2e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  43.57 
 
 
328 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 
328 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 
327 aa  278  1e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  43.34 
 
 
328 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  42.64 
 
 
328 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  42.77 
 
 
328 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  41.8 
 
 
327 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  41.88 
 
 
330 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  41.88 
 
 
330 aa  276  3e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  41.36 
 
 
337 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  42.24 
 
 
331 aa  275  5e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  42.86 
 
 
332 aa  275  9e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  41.43 
 
 
330 aa  273  3e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  41.3 
 
 
337 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  40.68 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  42.95 
 
 
324 aa  272  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  43.44 
 
 
332 aa  272  6e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  43.65 
 
 
328 aa  271  8.000000000000001e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  41.64 
 
 
328 aa  271  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  42.27 
 
 
320 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 
324 aa  268  8.999999999999999e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  41.98 
 
 
332 aa  268  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  38.74 
 
 
332 aa  268  1e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  41.98 
 
 
332 aa  267  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  40.94 
 
 
327 aa  266  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  41.74 
 
 
337 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  43.38 
 
 
333 aa  265  8e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  41.18 
 
 
332 aa  265  8e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  42.63 
 
 
329 aa  265  1e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  41.56 
 
 
330 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  40.13 
 
 
330 aa  264  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  41.25 
 
 
330 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  41.25 
 
 
330 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  41.25 
 
 
330 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  41.72 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  40.67 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  40.67 
 
 
330 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  41.56 
 
 
330 aa  261  8e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  42.37 
 
 
331 aa  260  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  40.94 
 
 
330 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  39.44 
 
 
323 aa  260  3e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  39.63 
 
 
323 aa  259  4e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  39.94 
 
 
330 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  43.26 
 
 
349 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  40.44 
 
 
326 aa  258  1e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  39.56 
 
 
329 aa  256  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2821  UDP-glucose 4-epimerase  38.56 
 
 
332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  38.01 
 
 
328 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  40.12 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  41.25 
 
 
330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  38.32 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  43.53 
 
 
324 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18321  UDP-glucose 4-epimerase  41.45 
 
 
348 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.161705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  42.99 
 
 
328 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  38.24 
 
 
329 aa  250  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  43.22 
 
 
321 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  39.56 
 
 
329 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  40.06 
 
 
327 aa  248  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  40.57 
 
 
332 aa  248  9e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  38.24 
 
 
327 aa  248  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  38.7 
 
 
350 aa  247  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  42.06 
 
 
325 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1573  UDP-glucose 4-epimerase  39.01 
 
 
328 aa  247  2e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.95776  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  39.25 
 
 
329 aa  245  6e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  40.13 
 
 
330 aa  245  6.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  40.56 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  36.5 
 
 
327 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>