More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2760 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  100 
 
 
330 aa  676    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  57.94 
 
 
330 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  53.8 
 
 
328 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  55.28 
 
 
330 aa  345  5e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  55.28 
 
 
330 aa  345  7e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  53 
 
 
328 aa  342  5.999999999999999e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  53.5 
 
 
328 aa  341  8e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  52.4 
 
 
327 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  53.04 
 
 
327 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  54.43 
 
 
328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  50.79 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  52.17 
 
 
324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  53.77 
 
 
324 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  51.42 
 
 
327 aa  323  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  51.72 
 
 
327 aa  322  5e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  51.1 
 
 
327 aa  322  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  51.72 
 
 
331 aa  318  7e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 
324 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  52.32 
 
 
328 aa  316  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 
321 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  51.85 
 
 
329 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  49.08 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  50.93 
 
 
332 aa  312  4.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  50.79 
 
 
354 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  47.71 
 
 
337 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  50.31 
 
 
332 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  47.4 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  48.44 
 
 
327 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 
330 aa  305  7e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  50.63 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  50.79 
 
 
349 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 
329 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  46.13 
 
 
331 aa  298  8e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  48.44 
 
 
323 aa  297  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  47.5 
 
 
327 aa  297  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  48.61 
 
 
329 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  46.88 
 
 
328 aa  295  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 
329 aa  295  6e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.04 
 
 
324 aa  295  9e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 
328 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  45.34 
 
 
330 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  45.34 
 
 
330 aa  294  2e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 
330 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  47.19 
 
 
328 aa  292  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  46.56 
 
 
328 aa  292  5e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 
328 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
328 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 
327 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
330 aa  290  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
330 aa  290  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
330 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
330 aa  290  2e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
330 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  46.71 
 
 
332 aa  290  2e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
330 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 
330 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 
329 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  48.16 
 
 
332 aa  288  8e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  47.66 
 
 
337 aa  286  2e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 
324 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 
328 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 
332 aa  284  1.0000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  45.34 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 
320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  45.03 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  47.35 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  48.84 
 
 
356 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 
330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 
329 aa  282  5.000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  45.31 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  47.53 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 
332 aa  281  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  45.82 
 
 
332 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.34 
 
 
326 aa  281  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  45.48 
 
 
328 aa  280  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.31 
 
 
333 aa  278  8e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  47.78 
 
 
338 aa  277  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  43.21 
 
 
325 aa  277  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  49.83 
 
 
318 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  43.83 
 
 
333 aa  275  7e-73  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  45.2 
 
 
333 aa  275  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  44.83 
 
 
329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.27 
 
 
334 aa  273  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 
330 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 
331 aa  272  6e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 
332 aa  272  6e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 
329 aa  269  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  41.25 
 
 
330 aa  268  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  42.68 
 
 
330 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 
328 aa  266  5e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1115  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 
326 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.423931  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  44.38 
 
 
328 aa  263  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  42.11 
 
 
334 aa  263  3e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 
321 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  48.3 
 
 
316 aa  263  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 
351 aa  262  6e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1914  UDP-galactose 4-epimerase  46.57 
 
 
335 aa  262  6.999999999999999e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.810767  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  47.12 
 
 
331 aa  261  8e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>