More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1718 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1718  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 318 aa  653    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.818272  normal  0.619899 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0159  UDP-galactose 4-epimerase  49.84 
 
 		 330 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.15603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  49.52 
 
 		 330 aa  300  3e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1332  UDP-glucose 4-epimerase  49.68 
 
 		 330 aa  294  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  49.31 
 
 		 324 aa  285  5.999999999999999e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  50.85 
 
 		 329 aa  281  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  47.75 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  49.15 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3672  UDP-glucose 4-epimerase  50.52 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0118315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  48.98 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4416  UDP-glucose 4-epimerase  47.24 
 
 		 328 aa  271  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0543  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 328 aa  268  8.999999999999999e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0474  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 328 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.814056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  47.3 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  47.6 
 
 		 331 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  42.9 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2760  UDP-galactose 4-epimerase  49.83 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.467809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  42.5 
 
 		 324 aa  259  6e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  45.42 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  44.9 
 
 		 323 aa  257  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  47.14 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0136  UDP-glucose 4-epimerase  47.26 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.763249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3022  UDP-glucose 4-epimerase  45.36 
 
 		 349 aa  256  4e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  45.99 
 
 		 337 aa  255  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  46.37 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  46.37 
 
 		 328 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  45.39 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1626  UDP-galactose 4-epimerase  46.37 
 
 		 331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  40.5 
 
 		 326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  42.27 
 
 		 327 aa  252  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  42.28 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  47.27 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  44.83 
 
 		 327 aa  248  8e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  42.77 
 
 		 333 aa  246  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  44.75 
 
 		 332 aa  246  4.9999999999999997e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  45.39 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  42.52 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4942  UDP-glucose 4-epimerase  46.05 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0332152  normal  0.293116 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  44.3 
 
 		 328 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  42.71 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  41.67 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  43.23 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  45.17 
 
 		 329 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  41.88 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  41.33 
 
 		 337 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  43.84 
 
 		 332 aa  239  6.999999999999999e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  45.02 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  43.1 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  45.03 
 
 		 323 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4187  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  43.24 
 
 		 324 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  43.71 
 
 		 330 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  43.3 
 
 		 332 aa  236  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  43 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  41.78 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  42.09 
 
 		 353 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  42.52 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  42.52 
 
 		 330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  43.73 
 
 		 320 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  43.45 
 
 		 327 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  43.06 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  43.2 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  43.37 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 332 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  44.06 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  42.81 
 
 		 331 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  43.99 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  43.49 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  41.84 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  41.08 
 
 		 329 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  41.28 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  43.34 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  42.14 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  42.11 
 
 		 327 aa  225  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  44.63 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  42.07 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  43.99 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 321 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 324 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  44.44 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  40.82 
 
 		 326 aa  223  4.9999999999999996e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  44.93 
 
 		 319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1657  UDP-glucose 4-epimerase  44.75 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.408778  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  42.56 
 
 		 329 aa  222  7e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  42.21 
 
 		 329 aa  221  9e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0489  UDP-glucose 4-epimerase  43.43 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14151  UDP-glucose 4-epimerase  39.66 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  40.64 
 
 		 336 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  43.58 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  41.98 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  41.72 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  44.22 
 
 		 320 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3129  UDP-glucose 4-epimerase  44.78 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.86735 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  40.53 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  41.86 
 
 		 337 aa  218  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  42.37 
 
 		 339 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  42.12 
 
 		 351 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>