More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1465 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 323 aa  647    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  63.44 
 
 		 320 aa  383  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  61.35 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  58.75 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  61.73 
 
 		 321 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  62.31 
 
 		 320 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  61.64 
 
 		 319 aa  359  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  60.99 
 
 		 321 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  59.06 
 
 		 320 aa  357  9.999999999999999e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  57.89 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  60.5 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  55.11 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  54.04 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  52.8 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  54.37 
 
 		 328 aa  328  5.0000000000000004e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  49.69 
 
 		 331 aa  312  5.999999999999999e-84  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 		 328 aa  309  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 		 328 aa  309  5e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 328 aa  308  6.999999999999999e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  48.16 
 
 		 330 aa  308  8e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  50.92 
 
 		 333 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  50 
 
 		 354 aa  303  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 328 aa  302  6.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  47.85 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.76 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  50.77 
 
 		 331 aa  299  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  48 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  47.85 
 
 		 332 aa  298  1e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  54.29 
 
 		 327 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  47.53 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  46.15 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 326 aa  296  4e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  47.52 
 
 		 327 aa  296  5e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  54.74 
 
 		 327 aa  295  6e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  45.09 
 
 		 330 aa  295  7e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  51.23 
 
 		 329 aa  294  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  47.55 
 
 		 324 aa  294  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 328 aa  292  5e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 329 aa  292  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 330 aa  291  7e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  47.69 
 
 		 334 aa  291  8e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  46.63 
 
 		 330 aa  291  9e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 330 aa  291  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 327 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  46.6 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 328 aa  289  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 323 aa  289  6e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  47.38 
 
 		 332 aa  288  1e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  47.53 
 
 		 333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  46.3 
 
 		 328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  45.71 
 
 		 332 aa  285  8e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  47.22 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.09 
 
 		 324 aa  284  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 329 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.54 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.65 
 
 		 333 aa  277  2e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  46.89 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1503  UDP-glucose 4-epimerase  48.46 
 
 		 324 aa  276  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.615148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 334 aa  275  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 326 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  47.68 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 351 aa  273  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  48.62 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  43.87 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3768  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0160561 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  46.6 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  46.81 
 
 		 329 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0580  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  47.53 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  44.17 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 		 330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  45.76 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 		 326 aa  269  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  44.75 
 
 		 332 aa  268  7e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  47.99 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0867  UDP-galactose 4-epimerase  48.16 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640943  normal  0.227397 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  46.32 
 
 		 329 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  46.44 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  47.38 
 
 		 339 aa  266  4e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  44.44 
 
 		 330 aa  265  7e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 		 325 aa  265  7e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  44.44 
 
 		 332 aa  265  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  40.87 
 
 		 328 aa  265  8e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  45.2 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  45.99 
 
 		 330 aa  263  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>