More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0647 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 334 aa  678    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  86.02 
 
 		 351 aa  578  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  52.89 
 
 		 329 aa  350  2e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  51.54 
 
 		 354 aa  342  5e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  51.53 
 
 		 326 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  51.99 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  52.13 
 
 		 331 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  52.2 
 
 		 328 aa  335  7e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  50.15 
 
 		 327 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  50.46 
 
 		 328 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 328 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  47.38 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  49.39 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  47.08 
 
 		 331 aa  322  4e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  46.79 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  46.79 
 
 		 330 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 330 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 330 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 330 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  46.18 
 
 		 330 aa  318  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  46.93 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  44.92 
 
 		 327 aa  315  8e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  47.81 
 
 		 324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  49.07 
 
 		 329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 329 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 		 329 aa  312  5.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  45.4 
 
 		 330 aa  311  1e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  48.28 
 
 		 332 aa  309  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  47.09 
 
 		 333 aa  308  6.999999999999999e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  50.16 
 
 		 327 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 328 aa  305  6e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  45.26 
 
 		 330 aa  305  8.000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  48.92 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  50.47 
 
 		 331 aa  303  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  47.17 
 
 		 333 aa  302  6.000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  45.37 
 
 		 326 aa  300  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 		 338 aa  298  1e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  45.43 
 
 		 328 aa  298  1e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  48.77 
 
 		 330 aa  297  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  45.96 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  45.28 
 
 		 324 aa  295  9e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  46.89 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  43.52 
 
 		 332 aa  294  1e-78  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  46.2 
 
 		 321 aa  294  2e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  48.11 
 
 		 324 aa  292  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  45.79 
 
 		 325 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  49.37 
 
 		 331 aa  293  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  44.27 
 
 		 326 aa  290  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  46.13 
 
 		 332 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  46.08 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  45.23 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  45.6 
 
 		 326 aa  288  6e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.29 
 
 		 334 aa  288  7e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4249  UDP-galactose 4-epimerase  45.54 
 
 		 327 aa  286  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.444052 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0016  UDP-galactose 4-epimerase  47.65 
 
 		 327 aa  287  2e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00490558  normal  0.701092 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  43.52 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 		 327 aa  285  5e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  44.92 
 
 		 332 aa  285  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  50.16 
 
 		 319 aa  285  8e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  48.58 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  47.96 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  46.27 
 
 		 332 aa  284  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  41.72 
 
 		 328 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  42.77 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  48.9 
 
 		 328 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  48.9 
 
 		 328 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  48.26 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  50.79 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  46.37 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  49.06 
 
 		 329 aa  279  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  48.1 
 
 		 326 aa  278  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 330 aa  278  1e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3065  UDP-glucose 4-epimerase  47.22 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  45.14 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  46.06 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  47.66 
 
 		 323 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  47.63 
 
 		 327 aa  275  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  47 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3859  UDP-glucose 4-epimerase  47.47 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.126757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  46.92 
 
 		 356 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  47.95 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  47.32 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  47.32 
 
 		 320 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  47 
 
 		 330 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  48.51 
 
 		 318 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  47 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  46.2 
 
 		 337 aa  272  7e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>