More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0795 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0795  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 327 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0739  UDP-glucose 4-epimerase  90.18 
 
 		 327 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209358  hitchhiker  0.00614298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  60.38 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  62.38 
 
 		 316 aa  371  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  60.44 
 
 		 319 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  59.63 
 
 		 318 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1261  UDP-glucose 4-epimerase  58.64 
 
 		 321 aa  351  8e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  57.86 
 
 		 327 aa  350  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0893  UDP-glucose 4-epimerase  59.19 
 
 		 321 aa  345  5e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0932116 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27520  UDP-galactose 4-epimerase  58.9 
 
 		 321 aa  339  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  59.25 
 
 		 320 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  57.19 
 
 		 329 aa  333  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  55.83 
 
 		 320 aa  332  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  55.28 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  54.29 
 
 		 323 aa  322  6e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  54.43 
 
 		 322 aa  315  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  49.53 
 
 		 328 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 		 330 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0282  UDP-glucose 4-epimerase  48.15 
 
 		 328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  48.91 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0119  UDP-glucose 4-epimerase  48.62 
 
 		 328 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.500269  hitchhiker  0.00370533 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0273  UDP-glucose 4-epimerase  47.84 
 
 		 328 aa  304  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 327 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2654  UDP-glucose 4-epimerase  49.23 
 
 		 329 aa  300  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.933262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 328 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  48.92 
 
 		 354 aa  300  3e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1771  UDP-glucose 4-epimerase  46.93 
 
 		 328 aa  298  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1509  UDP-glucose 4-epimerase  48.31 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0386563  normal  0.0493544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  49.85 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  49.08 
 
 		 324 aa  289  6e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  46.63 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  49.69 
 
 		 329 aa  288  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  44.31 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 330 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 330 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  46.11 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1702  UDP-galactose 4-epimerase  48.63 
 
 		 331 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  44.89 
 
 		 329 aa  279  5e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  46.48 
 
 		 333 aa  278  6e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  48.59 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  49.54 
 
 		 351 aa  276  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  48.48 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1068  UDP-galactose 4-epimerase  44.31 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.715245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  45.06 
 
 		 333 aa  275  8e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0043  UDP-glucose 4-epimerase  43.34 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  48.15 
 
 		 327 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  46.36 
 
 		 324 aa  271  9e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1923  UDP-glucose 4-epimerase  44.34 
 
 		 331 aa  271  1e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0041  UDP-glucose 4-epimerase  43.03 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  45.82 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  44.62 
 
 		 332 aa  269  4e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0284  UDP-galactose 4-epimerase  43.38 
 
 		 330 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.555091  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2693  UDP-glucose 4-epimerase  45.96 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212619  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  47.37 
 
 		 331 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  42.55 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  47.06 
 
 		 329 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1089  UDP-glucose 4-epimerase  46.42 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1776  UDP-glucose 4-epimerase  42.86 
 
 		 330 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.098997  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0420  UDP-glucose 4-epimerase  43.87 
 
 		 328 aa  264  1e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  41.43 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4242  UDP-glucose 4-epimerase  44.27 
 
 		 332 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2299  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 		 332 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0652  UDP-galactose 4-epimerase  45.71 
 
 		 328 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.276662  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0208  UDP-glucose 4-epimerase  48.29 
 
 		 328 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.163102  normal  0.146368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2305  UDP-glucose 4-epimerase  44.82 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.738706  normal  0.125833 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  41.49 
 
 		 326 aa  259  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0137  UDP-glucose 4-epimerase  46.86 
 
 		 356 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.169815 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4455  UDP-glucose 4-epimerase  43.83 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000044018  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0322  UDP-glucose 4-epimerase  41.49 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  41.36 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1125  UDP-glucose 4-epimerase  44.28 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.333219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  42.15 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  42.15 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1342  UDP-glucose 4-epimerase  45.54 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  43.03 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  47.13 
 
 		 330 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  41.54 
 
 		 326 aa  255  6e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  44.44 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0768  UDP-galactose 4-epimerase  44.51 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2250  UDP-glucose 4-epimerase  42.24 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  47.66 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  47.59 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  42.72 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2296  UDP-glucose 4-epimerase  44.48 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0685496  normal  0.285831 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2726  UDP-glucose 4-epimerase  46.6 
 
 		 324 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00760058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2586  UDP-glucose 4-epimerase  48.01 
 
 		 321 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1249  UDP-glucose 4-epimerase  39.7 
 
 		 328 aa  251  8.000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2290  UDP-glucose 4-epimerase  43.08 
 
 		 325 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.328872  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  41.9 
 
 		 327 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  46.36 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>