More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8174 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8174  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 319 aa  628  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0431  UDP-glucose 4-epimerase  60.94 
 
 		 325 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1401  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 325 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33990  UDP-galactose 4-epimerase  50.63 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.107891  normal  0.629756 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3495  UDP-glucose 4-epimerase  52.23 
 
 		 322 aa  291  7e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5175  UDP-galactose 4-epimerase  50.97 
 
 		 329 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0757112  normal  0.0801744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4789  UDP-galactose 4-epimerase  50.32 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4875  UDP-galactose 4-epimerase  50.32 
 
 		 329 aa  287  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  0.071217 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2895  UDP-glucose 4-epimerase  52.34 
 
 		 326 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05730  UDP-galactose 4-epimerase  50.32 
 
 		 333 aa  281  7.000000000000001e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.805791  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3871  UDP-glucose 4-epimerase  50 
 
 		 320 aa  275  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00454433 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09200  UDP-galactose 4-epimerase  48.89 
 
 		 332 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2268  UDP-glucose 4-epimerase  47.98 
 
 		 328 aa  272  5.000000000000001e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.802009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5389  UDP-glucose 4-epimerase  50.48 
 
 		 326 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.925901  hitchhiker  0.00813598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4464  UDP-glucose 4-epimerase  48.74 
 
 		 324 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1119  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 336 aa  265  5.999999999999999e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.368347 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1836  UDP-glucose 4-epimerase  47.69 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.0000102298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0040  UDP-glucose 4-epimerase  48.38 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1950  UDP-glucose 4-epimerase  45.68 
 
 		 328 aa  250  3e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00010158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  46.04 
 
 		 323 aa  246  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2339  UDP-glucose 4-epimerase  44.72 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000378791  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4862  UDP-glucose 4-epimerase  47.83 
 
 		 322 aa  242  6e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.997922 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1769  UDP-glucose 4-epimerase  47 
 
 		 320 aa  242  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.818465  normal  0.0921457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  44.79 
 
 		 324 aa  242  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  44.27 
 
 		 337 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3275  UDP-galactose 4-epimerase  41.56 
 
 		 333 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768237  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3171  UDP-glucose 4-epimerase  46.46 
 
 		 327 aa  236  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1676  UDP-galactose 4-epimerase  46.54 
 
 		 329 aa  236  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000240695 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2340  UDP-glucose 4-epimerase  45.65 
 
 		 328 aa  235  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.169139  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  45.78 
 
 		 330 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3215  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 329 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00104083  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  43.96 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  46.73 
 
 		 336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  42.3 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  44.92 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  46.79 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4513  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0777  UDP-galactose 4-epimerase  45.9 
 
 		 329 aa  229  3e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107594  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  45.42 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  43.47 
 
 		 337 aa  229  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  40.66 
 
 		 337 aa  228  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2978  UDP-galactose 4-epimerase  41.88 
 
 		 339 aa  228  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.295177 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1048  UDP-glucose 4-epimerase  43.94 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034868 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  43.69 
 
 		 350 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4439  UDP-glucose 4-epimerase  43.12 
 
 		 332 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  45.45 
 
 		 330 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  46.39 
 
 		 316 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  39.5 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0163  UDP-galactose 4-epimerase  43.5 
 
 		 331 aa  226  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.507846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1125  UDP-glucose 4-epimerase  39.82 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  44.01 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2240  UDP-glucose 4-epimerase  44 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3471  UDP-glucose 4-epimerase  44.81 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1866  UDP-glucose 4-epimerase  41.98 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1088  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 		 329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  37.38 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1012  UDP-glucose 4-epimerase  42.19 
 
 		 327 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  44.34 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  40 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  43.34 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  40.8 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5114  UDP-glucose 4-epimerase  41.18 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1047  UDP-galactose 4-epimerase  43.93 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240501 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2870  UDP-glucose 4-epimerase  40.79 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00371745  hitchhiker  0.000000287874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1807  UDP-glucose 4-epimerase  41.98 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5505  UDP-glucose 4-epimerase  41.18 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.678064  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4679  UDP-glucose 4-epimerase  45.63 
 
 		 338 aa  224  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.60579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2451  UDP-glucose 4-epimerase  44.1 
 
 		 341 aa  223  3e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0563953  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1183  UDP-glucose 4-epimerase  43.83 
 
 		 351 aa  223  3e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.119771  normal  0.642661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5062  UDP-glucose 4-epimerase  41.25 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5434  UDP-glucose 4-epimerase  40.87 
 
 		 330 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1513  UDP-glucose 4-epimerase  41.14 
 
 		 337 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282439  normal  0.362537 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4945  UDP-glucose 4-epimerase  40.87 
 
 		 330 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4960  UDP-glucose 4-epimerase  40.87 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00145973  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0647  UDP-glucose 4-epimerase  42.59 
 
 		 334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5354  UDP-glucose 4-epimerase  40.87 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2973  UDP-glucose 4-epimerase  43.27 
 
 		 331 aa  222  6e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5380  UDP-glucose 4-epimerase  40.87 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0320  UDP-galactose 4-epimerase  42.51 
 
 		 332 aa  222  8e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2224  UDP-glucose 4-epimerase  41.46 
 
 		 336 aa  221  9e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00168227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3273  UDP-glucose 4-epimerase  43.17 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.995045 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0187  UDP-galactose 4-epimerase  41.47 
 
 		 344 aa  221  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.611091  decreased coverage  0.00729822 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5056  UDP-glucose 4-epimerase  40.25 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2242  UDP-galactose 4-epimerase  38.41 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3696  UDP-glucose 4-epimerase  44.14 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0207521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3597  UDP-glucose 4-epimerase  42.86 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.55309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  39.38 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  44.41 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2676  UDP-galactose 4-epimerase  39.82 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0763555  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  39.82 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  46.71 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1486  UDP-galactose 4-epimerase  43.69 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.608224 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  40.82 
 
 		 328 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0877  UDP-glucose 4-epimerase  44.55 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1793  UDP-glucose 4-epimerase  46.91 
 
 		 330 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1482  UDP-glucose 4-epimerase  40.24 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000762592  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2609  UDP-galactose 4-epimerase  39.88 
 
 		 337 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.237323  hitchhiker  0.000000619573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  43.93 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>