More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1271 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.19 
 
 
370 aa  660    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
370 aa  740    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  92.16 
 
 
388 aa  678    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  89.73 
 
 
370 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  85.14 
 
 
370 aa  629  1e-179  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.66 
 
 
372 aa  527  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.58 
 
 
391 aa  509  1e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.01 
 
 
372 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.74 
 
 
372 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.01 
 
 
372 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.31 
 
 
373 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.54 
 
 
368 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.87 
 
 
369 aa  395  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 
368 aa  395  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.88 
 
 
368 aa  393  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  56.79 
 
 
368 aa  386  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.79 
 
 
368 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.91 
 
 
373 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.37 
 
 
373 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.28 
 
 
372 aa  333  4e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.88 
 
 
377 aa  325  6e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.24 
 
 
382 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903848  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
379 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.36 
 
 
379 aa  281  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.93 
 
 
376 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  42.93 
 
 
384 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  36.94 
 
 
378 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.68 
 
 
347 aa  229  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.31 
 
 
352 aa  219  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.92 
 
 
364 aa  218  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.78 
 
 
373 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.55 
 
 
343 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.21 
 
 
370 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38 
 
 
373 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.33 
 
 
364 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.33 
 
 
356 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.33 
 
 
356 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.33 
 
 
356 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.33 
 
 
356 aa  199  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.33 
 
 
363 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  35.33 
 
 
363 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  35.04 
 
 
363 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.02 
 
 
352 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227922  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
354 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
310 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03160  sugar nucleotide epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
358 aa  181  1e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123256  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  38.66 
 
 
346 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
313 aa  176  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.29 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0144  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  39.21 
 
 
287 aa  172  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.120454  normal  0.0125946 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.84 
 
 
343 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.84 
 
 
343 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0935315  normal  0.0287861 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 
310 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.4 
 
 
309 aa  168  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.81 
 
 
313 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.84 
 
 
343 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534805  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
309 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
322 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.12 
 
 
310 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.96 
 
 
321 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1181  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
310 aa  162  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
343 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.85 
 
 
327 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.2 
 
 
298 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  33.33 
 
 
319 aa  159  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
306 aa  159  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
327 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
310 aa  157  2e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 
312 aa  158  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.58 
 
 
330 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 
325 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.79 
 
 
307 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.79 
 
 
311 aa  153  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
305 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.27 
 
 
348 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 
329 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
309 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
343 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 
335 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
309 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
313 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.81 
 
 
309 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.22 
 
 
328 aa  150  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 
331 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0099  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
342 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
308 aa  148  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  36.58 
 
 
309 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.3 
 
 
308 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
328 aa  146  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
306 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>