More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0144 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0144  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  100 
 
 
287 aa  594  1e-169  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.120454  normal  0.0125946 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.7 
 
 
375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03160  sugar nucleotide epimerase/dehydratase  38.36 
 
 
358 aa  203  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.33 
 
 
354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.61 
 
 
379 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  40.93 
 
 
384 aa  198  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  40.5 
 
 
363 aa  198  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.86 
 
 
364 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.86 
 
 
356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.86 
 
 
356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.86 
 
 
356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.86 
 
 
356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.86 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  40.86 
 
 
363 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.21 
 
 
379 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.56 
 
 
382 aa  185  7e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  39.86 
 
 
378 aa  183  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 
376 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 
391 aa  178  7e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.58 
 
 
368 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 
373 aa  175  9e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 
373 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.43 
 
 
370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 
370 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.21 
 
 
370 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.21 
 
 
388 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.57 
 
 
372 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.71 
 
 
373 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.63 
 
 
370 aa  169  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 
372 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 
372 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 
372 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
368 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.28 
 
 
369 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  37.63 
 
 
368 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.28 
 
 
368 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.59 
 
 
372 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.28 
 
 
368 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
377 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 
352 aa  135  9e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.57 
 
 
373 aa  132  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
309 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.69 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227922  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.99 
 
 
311 aa  128  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
347 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.72 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
313 aa  125  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.66 
 
 
307 aa  124  3e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  31.07 
 
 
346 aa  122  8e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.8 
 
 
298 aa  117  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
370 aa  117  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.06 
 
 
343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0935315  normal  0.0287861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
331 aa  113  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
343 aa  113  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534805  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.74 
 
 
318 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
322 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.31 
 
 
303 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
331 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
308 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
285 aa  106  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 
321 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
373 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
313 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
321 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
317 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
301 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.11 
 
 
306 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
325 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.47 
 
 
311 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
315 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  29.51 
 
 
302 aa  103  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
310 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
309 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.14 
 
 
313 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
326 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 
316 aa  101  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.95 
 
 
350 aa  100  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
314 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
310 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
310 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
310 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.64 
 
 
343 aa  99.8  5e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
321 aa  99.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
296 aa  99  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
310 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
388 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.78 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.68 
 
 
323 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
330 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.62 
 
 
330 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
309 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.67 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>