More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4198 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
354 aa  721    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.3 
 
 
363 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  59.3 
 
 
363 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.3 
 
 
356 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.3 
 
 
356 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.3 
 
 
356 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  58.89 
 
 
363 aa  421  1e-117  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.3 
 
 
364 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.3 
 
 
356 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.23 
 
 
364 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03160  sugar nucleotide epimerase/dehydratase  51.14 
 
 
358 aa  333  4e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123256  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.22 
 
 
379 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.27 
 
 
379 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.63 
 
 
375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  39.44 
 
 
384 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.66 
 
 
376 aa  237  3e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.38 
 
 
382 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903848  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
378 aa  217  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
372 aa  208  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.21 
 
 
373 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0144  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  38.33 
 
 
287 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.120454  normal  0.0125946 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.8 
 
 
370 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
370 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
388 aa  193  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.01 
 
 
391 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.52 
 
 
373 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.24 
 
 
369 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
373 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
372 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.1 
 
 
372 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.57 
 
 
370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.1 
 
 
372 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.92 
 
 
373 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.05 
 
 
347 aa  176  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  36.54 
 
 
368 aa  173  5e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
368 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
372 aa  170  3e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
368 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 
368 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
352 aa  166  8e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
377 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
343 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534805  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
343 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
343 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0935315  normal  0.0287861 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  34.66 
 
 
346 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
373 aa  143  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
352 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227922  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.09 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.65 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.36 
 
 
309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 
311 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
328 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.95 
 
 
326 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 
310 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.07 
 
 
308 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 
348 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
343 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.41 
 
 
310 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.05 
 
 
331 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18839  predicted protein  27.25 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.92 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.21 
 
 
310 aa  120  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
330 aa  120  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.81 
 
 
305 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.7 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.35 
 
 
335 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
313 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
313 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
306 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.37 
 
 
335 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  26.23 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.03 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.4 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  25.68 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
309 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.88 
 
 
313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  26.61 
 
 
321 aa  113  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.34 
 
 
336 aa  113  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
303 aa  113  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.4 
 
 
337 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.27 
 
 
301 aa  112  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
339 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.61 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.6 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.03 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.73 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.901656 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
315 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.45 
 
 
302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>