More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0415 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
326 aa  656    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  63.86 
 
 
325 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.15 
 
 
319 aa  394  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.11 
 
 
330 aa  353  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.76 
 
 
335 aa  347  1e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.37 
 
 
336 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  54.18 
 
 
337 aa  346  3e-94  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.96 
 
 
327 aa  343  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 
346 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.58 
 
 
327 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.21 
 
 
335 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.94 
 
 
337 aa  338  9e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.58 
 
 
331 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.69 
 
 
323 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.8 
 
 
335 aa  332  4e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.43 
 
 
340 aa  332  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 
335 aa  332  5e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  48.48 
 
 
339 aa  332  7.000000000000001e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.45 
 
 
345 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  49.24 
 
 
336 aa  331  8e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.24 
 
 
336 aa  331  1e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  48.48 
 
 
334 aa  331  1e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.21 
 
 
336 aa  331  1e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.24 
 
 
336 aa  331  1e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.79 
 
 
336 aa  330  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.87 
 
 
335 aa  330  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.42 
 
 
335 aa  330  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.36 
 
 
335 aa  330  2e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.8 
 
 
341 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  46.27 
 
 
332 aa  329  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.55 
 
 
336 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1681  putative nucleotide sugar epimerase  52.23 
 
 
348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.174267  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.74 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.78 
 
 
334 aa  328  1.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.38 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.02 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.05 
 
 
337 aa  326  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.94 
 
 
341 aa  326  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.19 
 
 
342 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.7 
 
 
335 aa  325  6e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  50 
 
 
334 aa  325  7e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  49.7 
 
 
335 aa  325  7e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  48.49 
 
 
337 aa  325  9e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  49.7 
 
 
335 aa  325  9e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03951  putative nucleotide sugar epimerase  51.63 
 
 
348 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.658541  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
337 aa  323  2e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.27 
 
 
339 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.24 
 
 
339 aa  322  4e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.4 
 
 
335 aa  323  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 
335 aa  322  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.78 
 
 
324 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.02 
 
 
335 aa  322  7e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.65 
 
 
333 aa  322  7e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.9 
 
 
324 aa  321  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  47.02 
 
 
339 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  47.72 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.15 
 
 
324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.55 
 
 
332 aa  320  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.45 
 
 
337 aa  320  3e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.81 
 
 
335 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.11 
 
 
335 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  47.6 
 
 
340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.24 
 
 
336 aa  319  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.33 
 
 
335 aa  318  6e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5384  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  52.28 
 
 
341 aa  318  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.11 
 
 
335 aa  318  9e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.42 
 
 
335 aa  317  1e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.55 
 
 
347 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.42 
 
 
336 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.84 
 
 
324 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.27 
 
 
335 aa  317  2e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  47.43 
 
 
336 aa  316  3e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.6 
 
 
358 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.79 
 
 
330 aa  316  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  48.33 
 
 
336 aa  315  5e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.27 
 
 
343 aa  315  5e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.41 
 
 
353 aa  314  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.74 
 
 
332 aa  314  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12841  putative nucleotide sugar epimerase  50.6 
 
 
345 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.363741  normal  0.0780964 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1313  putative nucleotide sugar epimerase  48.66 
 
 
355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.340796  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.24 
 
 
337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.22 
 
 
339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.43 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.24 
 
 
337 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.64 
 
 
341 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0430992  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.75 
 
 
337 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.26 
 
 
325 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.69 
 
 
335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.02 
 
 
336 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3735  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.31 
 
 
337 aa  312  4.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.607722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.43 
 
 
324 aa  312  5.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.98 
 
 
333 aa  312  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0803132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 
341 aa  311  6.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 
341 aa  311  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.82 
 
 
349 aa  311  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 
338 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  45.78 
 
 
337 aa  310  2e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1396  WbnF  46.53 
 
 
352 aa  310  2e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.62 
 
 
336 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>