More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0229 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 339 aa  694    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.76 
 
 		 336 aa  464  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.84 
 
 		 335 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  64.05 
 
 		 336 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.86 
 
 		 327 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  64.76 
 
 		 336 aa  454  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.25 
 
 		 336 aa  455  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.16 
 
 		 336 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.06 
 
 		 327 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.78 
 
 		 337 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.86 
 
 		 335 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.66 
 
 		 335 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.35 
 
 		 336 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.95 
 
 		 335 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  61.14 
 
 		 336 aa  442  1e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.24 
 
 		 335 aa  444  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  60.24 
 
 		 338 aa  441  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.49 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  60.42 
 
 		 336 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.58 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.52 
 
 		 340 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.24 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3735  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.93 
 
 		 337 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.607722  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.46 
 
 		 335 aa  434  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.84 
 
 		 337 aa  436  1e-121  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.63 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.36 
 
 		 336 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.34 
 
 		 339 aa  433  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  59.52 
 
 		 337 aa  431  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.13 
 
 		 336 aa  433  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.84 
 
 		 338 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.14 
 
 		 335 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.24 
 
 		 335 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.28 
 
 		 342 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.05 
 
 		 341 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.94 
 
 		 335 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.81 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.52 
 
 		 336 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  60.73 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0033  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  63.55 
 
 		 365 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.24 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.04 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.94 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  59.04 
 
 		 335 aa  424  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.4 
 
 		 344 aa  425  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.43 
 
 		 335 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 		 324 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 		 324 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.34 
 
 		 339 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.59 
 
 		 330 aa  422  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 		 324 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  59.82 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  60.3 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  57.88 
 
 		 334 aa  420  1e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  57.88 
 
 		 339 aa  419  1e-116  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.73 
 
 		 336 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  61.33 
 
 		 334 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  60 
 
 		 338 aa  420  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.7 
 
 		 334 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.3 
 
 		 338 aa  418  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.34 
 
 		 336 aa  418  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.42 
 
 		 324 aa  419  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.26 
 
 		 338 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.1 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.1 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.61 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.95 
 
 		 373 aa  412  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.42 
 
 		 333 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0803132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.42 
 
 		 341 aa  414  1e-114  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  56.05 
 
 		 340 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  56.8 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.63 
 
 		 335 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1313  putative nucleotide sugar epimerase  59.17 
 
 		 355 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.340796  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.82 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.82 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1396  WbnF  57.43 
 
 		 352 aa  405  1.0000000000000001e-112  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.508073  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 		 335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.94 
 
 		 353 aa  401  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.29 
 
 		 336 aa  403  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.2 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.18 
 
 		 336 aa  402  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  57.27 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  57.27 
 
 		 335 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.29 
 
 		 352 aa  401  1e-111  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216313  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.59 
 
 		 336 aa  404  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  56.97 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.67 
 
 		 335 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0223  putative nucleotide sugar epimerase  56.05 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0468  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  56.86 
 
 		 352 aa  401  9.999999999999999e-111  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.208737  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.67 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.51 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.97 
 
 		 335 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.4 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.09 
 
 		 352 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.93 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.94 
 
 		 335 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.31 
 
 		 345 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.36 
 
 		 335 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.36 
 
 		 335 aa  393  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  56.19 
 
 		 334 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>