More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2656 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 332 aa  681    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.42 
 
 		 324 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  54.65 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  54.49 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.55 
 
 		 322 aa  362  4e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0330143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.49 
 
 		 335 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.32 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  53.89 
 
 		 335 aa  359  4e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.35 
 
 		 336 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.86 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.17 
 
 		 335 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.86 
 
 		 324 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.06 
 
 		 327 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.87 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.23 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.23 
 
 		 324 aa  349  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.05 
 
 		 335 aa  350  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.22 
 
 		 330 aa  349  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.81 
 
 		 335 aa  346  3e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.27 
 
 		 342 aa  346  3e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.27 
 
 		 335 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.27 
 
 		 335 aa  345  6e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.35 
 
 		 335 aa  345  6e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.45 
 
 		 344 aa  345  8.999999999999999e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.7 
 
 		 323 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.91 
 
 		 336 aa  344  1e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.64 
 
 		 336 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.37 
 
 		 338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  50.76 
 
 		 339 aa  342  4e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52 
 
 		 328 aa  342  4e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.44 
 
 		 335 aa  342  5e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.67 
 
 		 337 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  50.76 
 
 		 334 aa  342  5.999999999999999e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.41 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.1 
 
 		 334 aa  340  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.79 
 
 		 336 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.2 
 
 		 335 aa  340  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.96 
 
 		 358 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  52.27 
 
 		 336 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.94 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  53.12 
 
 		 337 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3735  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.06 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.607722  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.47 
 
 		 341 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.12 
 
 		 335 aa  335  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.83 
 
 		 340 aa  335  7.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.36 
 
 		 336 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.39 
 
 		 330 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.64 
 
 		 336 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.41 
 
 		 336 aa  335  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.9 
 
 		 337 aa  335  9e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.31 
 
 		 332 aa  333  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.21 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3576  UDP-glucuronate 5'-epimerase  52.91 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.83 
 
 		 336 aa  333  3e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  51.83 
 
 		 336 aa  332  4e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.51 
 
 		 335 aa  332  4e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.37 
 
 		 331 aa  332  6e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.6 
 
 		 335 aa  331  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.39 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  52.13 
 
 		 336 aa  330  2e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  49.09 
 
 		 335 aa  330  2e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.28 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  51.21 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  50.75 
 
 		 334 aa  329  4e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.43 
 
 		 324 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.85 
 
 		 336 aa  328  6e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  50.89 
 
 		 340 aa  328  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  52.27 
 
 		 334 aa  328  9e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  51.36 
 
 		 336 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  50 
 
 		 336 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  51.22 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.73 
 
 		 318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.61 
 
 		 337 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  52.31 
 
 		 333 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0803132  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2235  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  53.15 
 
 		 334 aa  326  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.869767  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.31 
 
 		 341 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.54 
 
 		 338 aa  325  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.57 
 
 		 352 aa  325  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.76 
 
 		 339 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.65 
 
 		 336 aa  324  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  49.4 
 
 		 339 aa  323  3e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  50.91 
 
 		 337 aa  322  7e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  50.75 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.39 
 
 		 339 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.91 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.3 
 
 		 341 aa  319  5e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 		 337 aa  318  5e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.94 
 
 		 336 aa  318  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.49 
 
 		 337 aa  319  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.87 
 
 		 335 aa  318  6e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0844  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.46 
 
 		 332 aa  318  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.27 
 
 		 338 aa  317  1e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5384  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  49.39 
 
 		 341 aa  316  3e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.2 
 
 		 353 aa  316  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.23 
 
 		 335 aa  316  3e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.1 
 
 		 337 aa  316  3e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.46 
 
 		 339 aa  315  7e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.85 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  49.85 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.74 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>