More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1553 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 335 aa  682    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.53 
 
 		 332 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0844  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.97 
 
 		 332 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.96 
 
 		 335 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  56.19 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3735  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.79 
 
 		 337 aa  372  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.607722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.31 
 
 		 336 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.02 
 
 		 335 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.36 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.93 
 
 		 344 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.62 
 
 		 323 aa  363  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 		 335 aa  361  1e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  56.33 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.95 
 
 		 336 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.31 
 
 		 324 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.31 
 
 		 335 aa  358  9e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  54.98 
 
 		 336 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.61 
 
 		 330 aa  357  9.999999999999999e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.61 
 
 		 335 aa  358  9.999999999999999e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.35 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  50.76 
 
 		 339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.31 
 
 		 336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.28 
 
 		 336 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.31 
 
 		 324 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  50.76 
 
 		 334 aa  355  6.999999999999999e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.71 
 
 		 335 aa  355  8.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.06 
 
 		 327 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.76 
 
 		 327 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  52.11 
 
 		 337 aa  353  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 		 358 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.58 
 
 		 336 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.61 
 
 		 335 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.52 
 
 		 336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.31 
 
 		 335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.5 
 
 		 341 aa  352  4e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.19 
 
 		 336 aa  352  4e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  52.71 
 
 		 335 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.89 
 
 		 346 aa  351  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  52.55 
 
 		 335 aa  351  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  51.65 
 
 		 336 aa  351  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  52.41 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.41 
 
 		 335 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.06 
 
 		 324 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.71 
 
 		 335 aa  348  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.65 
 
 		 337 aa  347  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.11 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.41 
 
 		 335 aa  347  1e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.15 
 
 		 334 aa  345  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.8 
 
 		 336 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.51 
 
 		 335 aa  345  7e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.81 
 
 		 335 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  51.98 
 
 		 338 aa  344  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  51.51 
 
 		 336 aa  343  2e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.71 
 
 		 335 aa  343  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  50 
 
 		 337 aa  344  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.65 
 
 		 337 aa  342  4e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0033  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  51.51 
 
 		 365 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.51 
 
 		 335 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  50.75 
 
 		 338 aa  342  7e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.2 
 
 		 335 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.13 
 
 		 339 aa  341  9e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.47 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.21 
 
 		 336 aa  341  1e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.51 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 		 335 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.85 
 
 		 341 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  50.9 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3553  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.44 
 
 		 352 aa  340  2e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.37 
 
 		 337 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  50.45 
 
 		 334 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.9 
 
 		 337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.76 
 
 		 338 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.15 
 
 		 337 aa  338  7e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.22 
 
 		 339 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.08 
 
 		 338 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 		 327 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 		 340 aa  335  5e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  52.58 
 
 		 337 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.58 
 
 		 337 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.07 
 
 		 328 aa  332  8e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 		 331 aa  331  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.75 
 
 		 338 aa  331  9e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  49.7 
 
 		 332 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.61 
 
 		 330 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.11 
 
 		 336 aa  330  3e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0468  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  47.11 
 
 		 352 aa  328  5.0000000000000004e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.208737  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.96 
 
 		 373 aa  327  1.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.83 
 
 		 353 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.99 
 
 		 324 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  48.19 
 
 		 335 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.09 
 
 		 330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.7 
 
 		 336 aa  326  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 		 333 aa  325  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.8 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  46.22 
 
 		 352 aa  322  6e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216313  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  52.85 
 
 		 321 aa  322  8e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.85 
 
 		 324 aa  321  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.8 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  47.89 
 
 		 334 aa  319  5e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.04 
 
 		 322 aa  319  5e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0330143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>