More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA1983 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.72 
 
 
356 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 
363 aa  740    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  100 
 
 
363 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  97.52 
 
 
363 aa  724    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.72 
 
 
356 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 
364 aa  740    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.72 
 
 
356 aa  725    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  99.72 
 
 
356 aa  725    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.3 
 
 
354 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.8 
 
 
364 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03160  sugar nucleotide epimerase/dehydratase  52.99 
 
 
358 aa  361  1e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123256  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.28 
 
 
379 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  39.44 
 
 
384 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.23 
 
 
382 aa  242  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.07 
 
 
376 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.31 
 
 
375 aa  232  9e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.08 
 
 
379 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 
373 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
378 aa  209  6e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
372 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
369 aa  208  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 
370 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 
388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
370 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 
370 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0144  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  40.86 
 
 
287 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.120454  normal  0.0125946 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.36 
 
 
391 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.91 
 
 
372 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
373 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 
368 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.99 
 
 
372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 
370 aa  190  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 
372 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.28 
 
 
373 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.97 
 
 
368 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
372 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
373 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.37 
 
 
377 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
368 aa  176  6e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.18 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  36.26 
 
 
368 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
352 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
347 aa  173  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
373 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 
352 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227922  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  34 
 
 
346 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 
343 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 
343 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0935315  normal  0.0287861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.85 
 
 
343 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534805  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.76 
 
 
370 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.95 
 
 
313 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
309 aa  136  4e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.45 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
348 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.96 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
305 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.2 
 
 
307 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
303 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
308 aa  126  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
331 aa  126  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
310 aa  126  6e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
310 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.8 
 
 
333 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
313 aa  123  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.33 
 
 
343 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
314 aa  122  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
292 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  25.14 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 
323 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26 
 
 
323 aa  120  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.21 
 
 
296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.94 
 
 
292 aa  119  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.79 
 
 
338 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.75 
 
 
304 aa  119  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.14 
 
 
373 aa  119  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
336 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
320 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
328 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.43 
 
 
337 aa  117  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  23.31 
 
 
337 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
310 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.86 
 
 
306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  26.65 
 
 
336 aa  116  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
317 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0450  WbnF  23.3 
 
 
355 aa  116  6e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.48 
 
 
336 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
308 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.46 
 
 
285 aa  116  7.999999999999999e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3167  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.07 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.12 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.52 
 
 
337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.19 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.67 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2242  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.61 
 
 
377 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.366599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>