More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2170 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
375 aa  776    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.63 
 
 
379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
376 aa  280  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  38.73 
 
 
384 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.95 
 
 
382 aa  272  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903848  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.89 
 
 
379 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.63 
 
 
354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.875814  normal  0.757495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.79 
 
 
364 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3029  putative NAD dependent epimerase/dehydratase  36.1 
 
 
378 aa  239  6.999999999999999e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.5 
 
 
373 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014544 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1983  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.31 
 
 
363 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.064917  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3157  GepiA  41.31 
 
 
363 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0930  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.31 
 
 
364 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2760  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.31 
 
 
356 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00545494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.31 
 
 
356 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.722542  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3134  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.31 
 
 
356 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1845  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.31 
 
 
356 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0337067  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1476  UDP-glucose 4-epimerase, putative  40.91 
 
 
363 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1683  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
373 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0436408  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.92 
 
 
373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1060  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.29 
 
 
372 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0197  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
370 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.826654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.1 
 
 
370 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3887  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.79 
 
 
368 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00157391  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.02 
 
 
372 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0144  putative sugar nucleotide epimerase/dehydratase  42.7 
 
 
287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.120454  normal  0.0125946 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1188  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.75 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
370 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
372 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.12 
 
 
388 aa  209  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.791984  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.73 
 
 
370 aa  210  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.51 
 
 
368 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0520  NAD-dependent dehydratase/epimerase  38.9 
 
 
368 aa  209  7e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03160  sugar nucleotide epimerase/dehydratase  37.04 
 
 
358 aa  209  8e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.123256  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2172  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.9 
 
 
368 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0235632 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.43 
 
 
369 aa  203  4e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.85 
 
 
372 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0121065  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.36 
 
 
377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
391 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10547  UDP-glucose 4-epimerase galE3  33.91 
 
 
346 aa  186  7e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000700436  normal  0.976314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0976  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
373 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.466913 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2923  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
352 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000654958 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.71 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227922  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
370 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249574  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 
343 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0718  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.3 
 
 
343 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0935315  normal  0.0287861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
343 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534805  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
331 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.86 
 
 
333 aa  149  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.91 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.32 
 
 
309 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0708  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
343 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.127899 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.12 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
310 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
314 aa  139  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
323 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
299 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
323 aa  139  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
310 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
310 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
310 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.79 
 
 
309 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.71 
 
 
308 aa  133  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
305 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.88 
 
 
306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  27.95 
 
 
326 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
306 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
308 aa  130  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
309 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 
316 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.91 
 
 
309 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.2 
 
 
299 aa  125  9e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
316 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.38 
 
 
312 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.66 
 
 
317 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.32 
 
 
327 aa  124  4e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.15 
 
 
313 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.47 
 
 
318 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.33 
 
 
318 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
321 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
315 aa  120  3e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
285 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.37 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
310 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.25 
 
 
298 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 
301 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.73 
 
 
317 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.4 
 
 
328 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.85 
 
 
312 aa  119  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.51 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
318 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>