More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1178 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
317 aa  613  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.25 
 
 
318 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.3 
 
 
316 aa  271  1e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.7 
 
 
318 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  45.48 
 
 
316 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.09 
 
 
317 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.92 
 
 
324 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.26 
 
 
316 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.95 
 
 
333 aa  260  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
314 aa  255  9e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.71 
 
 
317 aa  253  3e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.21 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 
327 aa  207  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
593 aa  196  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  36.66 
 
 
323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 
322 aa  192  5e-48  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 
328 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 
328 aa  188  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 
397 aa  187  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.07 
 
 
317 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.68 
 
 
323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.8 
 
 
337 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
367 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.02 
 
 
337 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
324 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.37 
 
 
313 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 
408 aa  179  7e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
330 aa  178  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  31.07 
 
 
308 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.94 
 
 
310 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 
318 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
357 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.15 
 
 
339 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
342 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
328 aa  176  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.76 
 
 
332 aa  176  3e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
336 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.15 
 
 
336 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.06 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  34.55 
 
 
336 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 
333 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.85 
 
 
332 aa  172  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  38.49 
 
 
330 aa  172  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.72 
 
 
314 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4099  hypothetical protein  36.94 
 
 
334 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.104495 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.84 
 
 
335 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
313 aa  171  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
334 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
339 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
334 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.59701  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.94 
 
 
337 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 
341 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
312 aa  169  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.69 
 
 
318 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.55 
 
 
336 aa  169  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
324 aa  168  9e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
309 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  34.15 
 
 
335 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
309 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 
344 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  34.15 
 
 
335 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.1 
 
 
352 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  31.99 
 
 
337 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 
292 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.15 
 
 
336 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
311 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 
309 aa  166  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.71 
 
 
331 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
337 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.38 
 
 
330 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
339 aa  165  8e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 
296 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
327 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
335 aa  165  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.81 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3576  UDP-glucuronate 5'-epimerase  35.28 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_18839  predicted protein  38.37 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.26 
 
 
317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
338 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
335 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
311 aa  164  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.84 
 
 
335 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  35.35 
 
 
321 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
326 aa  163  3e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  36.08 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.12 
 
 
341 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 
373 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.84 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0330143  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>