More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0077 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
332 aa  689    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.67 
 
 
333 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4099  hypothetical protein  62.54 
 
 
334 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.104495 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.73 
 
 
334 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.73 
 
 
334 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.59701  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.12 
 
 
337 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0894672 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.76 
 
 
335 aa  383  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.52 
 
 
335 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.1 
 
 
350 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.32246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.17 
 
 
336 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3576  UDP-glucuronate 5'-epimerase  54.65 
 
 
335 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.68 
 
 
336 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.52 
 
 
341 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.94 
 
 
335 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.61 
 
 
337 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.12 
 
 
335 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  54.46 
 
 
336 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  55.39 
 
 
337 aa  369  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.01 
 
 
335 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.57 
 
 
336 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  55.12 
 
 
334 aa  368  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.19 
 
 
335 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.6 
 
 
332 aa  369  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3569  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.13 
 
 
334 aa  365  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.303688  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.01 
 
 
335 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.29 
 
 
335 aa  365  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.78 
 
 
337 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2640  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 
334 aa  364  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.24 
 
 
335 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.96 
 
 
338 aa  362  4e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.24 
 
 
336 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  52.38 
 
 
336 aa  361  8e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  52.99 
 
 
337 aa  360  1e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.71 
 
 
344 aa  359  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.22 
 
 
335 aa  359  4e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  52.71 
 
 
336 aa  358  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.81 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  50.9 
 
 
335 aa  357  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0033  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  52.27 
 
 
365 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.31 
 
 
336 aa  355  5e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  51.94 
 
 
336 aa  355  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.24 
 
 
335 aa  355  5e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.2 
 
 
335 aa  355  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.64 
 
 
335 aa  355  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  51.78 
 
 
338 aa  355  6.999999999999999e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.01 
 
 
342 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  52.1 
 
 
339 aa  354  1e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3924  UDP-glucuronic acid epimerase  52.71 
 
 
339 aa  354  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.85 
 
 
336 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  52.1 
 
 
334 aa  353  2e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3216  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.42 
 
 
337 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.162103  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.76 
 
 
327 aa  352  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.42 
 
 
337 aa  352  5e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.96 
 
 
338 aa  352  7e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.69 
 
 
336 aa  351  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.75 
 
 
340 aa  351  1e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.41 
 
 
324 aa  350  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 
327 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.57 
 
 
338 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3251  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 
337 aa  349  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.550526 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.66 
 
 
324 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 
337 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.586684 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.42 
 
 
346 aa  348  7e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.13 
 
 
341 aa  348  8e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3246  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.05 
 
 
338 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.61 
 
 
330 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  52.42 
 
 
335 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.11 
 
 
338 aa  346  4e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  52.42 
 
 
335 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.04 
 
 
341 aa  346  4e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.01 
 
 
335 aa  346  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.6 
 
 
336 aa  345  5e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.71 
 
 
335 aa  345  5e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.05 
 
 
335 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.64 
 
 
336 aa  345  7e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.34 
 
 
336 aa  345  8e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.2 
 
 
337 aa  344  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.42 
 
 
335 aa  344  1e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.24 
 
 
339 aa  344  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.36 
 
 
324 aa  343  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  52.12 
 
 
335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.87 
 
 
335 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.06 
 
 
324 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.73 
 
 
357 aa  342  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3735  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
337 aa  342  5e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.607722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.35 
 
 
336 aa  342  8e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0592  capsular polysaccharide biosynthesis protein  50.6 
 
 
334 aa  341  1e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.6 
 
 
339 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  49.11 
 
 
340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5621  nucleotide sugar epimerase  52.11 
 
 
338 aa  338  5e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.259916  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.71 
 
 
335 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.51 
 
 
343 aa  338  7e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.96 
 
 
335 aa  338  7e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.51 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12841  putative nucleotide sugar epimerase  49.27 
 
 
345 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.363741  normal  0.0780964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  50.76 
 
 
336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  49.1 
 
 
337 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.1 
 
 
337 aa  335  3.9999999999999995e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.1 
 
 
331 aa  335  9e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>