More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_2077 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
314 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.57 
 
 
317 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.19 
 
 
318 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.23 
 
 
318 aa  291  7e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  46.35 
 
 
316 aa  282  7.000000000000001e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.69 
 
 
316 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.01 
 
 
317 aa  278  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 
316 aa  267  2e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.08 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 
322 aa  209  4e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  38.34 
 
 
323 aa  206  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.22 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
327 aa  192  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 
324 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 
336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
328 aa  188  1e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.06 
 
 
332 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 
326 aa  185  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 
323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 
335 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
327 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13711  putative nucleotide sugar epimerase  35.28 
 
 
345 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.365086  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  34.63 
 
 
337 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  32.84 
 
 
339 aa  179  4e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.54 
 
 
334 aa  177  2e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
593 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2847  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
324 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
330 aa  177  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  34.29 
 
 
308 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
337 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.3 
 
 
328 aa  176  6e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 
340 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
373 aa  173  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.04 
 
 
336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  33.33 
 
 
337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
337 aa  172  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  34.89 
 
 
397 aa  172  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
324 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0025  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
338 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.730827  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 
322 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.638871  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
337 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
335 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
336 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
336 aa  170  2e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
324 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
336 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13971  putative nucleotide sugar epimerase  35.1 
 
 
342 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
341 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
335 aa  170  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
324 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
336 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1361  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
347 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
324 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  32.65 
 
 
336 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  34.16 
 
 
408 aa  170  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
335 aa  169  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  34.39 
 
 
325 aa  169  5e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
335 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
328 aa  169  5e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
335 aa  169  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
336 aa  169  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
335 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
324 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  32.54 
 
 
335 aa  168  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
335 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.93 
 
 
341 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
333 aa  167  2e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
335 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
313 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 
324 aa  167  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  32.54 
 
 
335 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
335 aa  167  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
339 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.34 
 
 
335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.43 
 
 
327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.64 
 
 
335 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
335 aa  166  4e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  31.95 
 
 
337 aa  166  5e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.64 
 
 
335 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.1 
 
 
328 aa  166  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
336 aa  165  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
332 aa  165  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 
341 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  32.54 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2048  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.77 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>