More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4435 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4435  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
317 aa  659    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.73 
 
 
317 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.05 
 
 
317 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.94 
 
 
318 aa  383  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 
408 aa  261  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.3 
 
 
324 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  42.72 
 
 
397 aa  252  7e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
342 aa  250  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
328 aa  245  6e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  40 
 
 
323 aa  245  9e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.32 
 
 
336 aa  244  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  41.62 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  41.51 
 
 
593 aa  244  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 
330 aa  242  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.68 
 
 
327 aa  241  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  41.57 
 
 
339 aa  240  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 
324 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.68 
 
 
327 aa  239  4e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.57 
 
 
337 aa  239  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.54 
 
 
343 aa  238  8e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.3 
 
 
323 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.32 
 
 
335 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.98 
 
 
345 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.88 
 
 
335 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3576  UDP-glucuronate 5'-epimerase  41.02 
 
 
335 aa  236  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 
324 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02926  nucleotide sugar epimerase  42.27 
 
 
321 aa  235  7e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  40.12 
 
 
335 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  40.12 
 
 
335 aa  233  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.96 
 
 
324 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 
335 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.11 
 
 
357 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13971  putative nucleotide sugar epimerase  38.58 
 
 
342 aa  233  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 
336 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.42 
 
 
341 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.82 
 
 
353 aa  232  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.64 
 
 
337 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 
335 aa  231  9e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 
335 aa  231  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  38.51 
 
 
340 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5384  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  38.58 
 
 
341 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.87 
 
 
331 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 
336 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  37.46 
 
 
335 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.36 
 
 
335 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.18 
 
 
336 aa  230  3e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 
322 aa  229  3e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 
335 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  40.13 
 
 
337 aa  230  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.72 
 
 
335 aa  230  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.81 
 
 
373 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  38.61 
 
 
325 aa  229  4e-59  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
337 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.36 
 
 
335 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.18 
 
 
335 aa  229  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  39.52 
 
 
335 aa  228  8e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.64 
 
 
336 aa  228  8e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 
335 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 
326 aa  228  8e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4589  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
334 aa  228  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  39.82 
 
 
336 aa  228  9e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 
336 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 
324 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4469  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
335 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
337 aa  228  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.59 
 
 
321 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  39.82 
 
 
337 aa  227  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.61 
 
 
336 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1313  putative nucleotide sugar epimerase  37.35 
 
 
355 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.340796  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.99 
 
 
335 aa  227  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.3 
 
 
373 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
335 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.97 
 
 
330 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  38.64 
 
 
338 aa  226  4e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.62 
 
 
335 aa  226  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.82 
 
 
342 aa  226  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.34 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
325 aa  225  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  38.67 
 
 
336 aa  225  6e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.32 
 
 
335 aa  225  7e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  39.88 
 
 
336 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.72 
 
 
336 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39.76 
 
 
337 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.76 
 
 
337 aa  224  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14357  predicted protein  37.88 
 
 
359 aa  224  1e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  39.63 
 
 
332 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  38.41 
 
 
336 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.52 
 
 
335 aa  224  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  37.72 
 
 
334 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.02 
 
 
337 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.67 
 
 
339 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
335 aa  223  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0038  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.32 
 
 
335 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.97 
 
 
336 aa  222  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3039  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.02 
 
 
335 aa  221  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179561  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  39.76 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.3 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.7 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>