More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2514 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
316 aa  656    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.52 
 
 
317 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  72.47 
 
 
316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.48 
 
 
316 aa  453  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.05 
 
 
318 aa  340  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.77 
 
 
318 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0957  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.47 
 
 
324 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0974176  normal 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5425  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.33 
 
 
317 aa  289  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.69 
 
 
314 aa  280  3e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.37 
 
 
333 aa  249  4e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.26 
 
 
317 aa  247  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
326 aa  223  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.8 
 
 
328 aa  223  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.37 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.32 
 
 
332 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00157026  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 
328 aa  217  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 
313 aa  211  9e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.34 
 
 
342 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.06 
 
 
313 aa  209  4e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.84 
 
 
335 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.73 
 
 
328 aa  206  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.05 
 
 
324 aa  206  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  39.42 
 
 
308 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 
312 aa  206  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
326 aa  203  3e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  34.88 
 
 
323 aa  203  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  38.51 
 
 
408 aa  202  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  35.93 
 
 
339 aa  202  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 
322 aa  201  9.999999999999999e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.86 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  35.93 
 
 
334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.24 
 
 
337 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.31 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.85 
 
 
341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
311 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.23 
 
 
327 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 
397 aa  199  6e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
593 aa  199  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0796  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.05 
 
 
344 aa  198  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.92 
 
 
327 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.17 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.85 
 
 
319 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 
318 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.34 
 
 
373 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 
336 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.61 
 
 
336 aa  193  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.42 
 
 
324 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.75 
 
 
335 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 
336 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.93 
 
 
342 aa  192  9e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  38.49 
 
 
325 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
317 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
317 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.8 
 
 
324 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0609  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.05 
 
 
337 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  37 
 
 
337 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.11 
 
 
324 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
337 aa  191  2e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.66 
 
 
328 aa  189  4e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 
323 aa  188  9e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0764  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
332 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 
336 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 
325 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 
309 aa  187  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 
318 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
336 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 
335 aa  186  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1634  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 
341 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0237866  hitchhiker  0.0000000224121 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1966  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.65 
 
 
333 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0803132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 
341 aa  185  7e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  36.53 
 
 
337 aa  185  7e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.42 
 
 
324 aa  185  8e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  36.04 
 
 
335 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.23 
 
 
337 aa  185  9e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  36.04 
 
 
335 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 
339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.863846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
310 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0409  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.42 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.34 
 
 
335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  36.39 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.23 
 
 
340 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.95 
 
 
336 aa  183  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
325 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.850459  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.13 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.12 
 
 
333 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.45 
 
 
332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.03 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0330143  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 
373 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.28 
 
 
327 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.547312 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
339 aa  182  7e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.54 
 
 
335 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.14 
 
 
335 aa  182  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
346 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>