More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0700 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
309 aa  631  1e-180  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.7 
 
 
311 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.77 
 
 
304 aa  384  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  61.26 
 
 
308 aa  369  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  51.94 
 
 
307 aa  332  4e-90  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.76 
 
 
310 aa  330  2e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.52 
 
 
313 aa  326  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.27 
 
 
313 aa  315  5e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  50.48 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 
312 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.49 
 
 
314 aa  297  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.22 
 
 
343 aa  295  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
322 aa  291  9e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 
339 aa  290  2e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.863846  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  46.54 
 
 
343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0099  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.5 
 
 
342 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.03 
 
 
327 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.6 
 
 
341 aa  281  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.98 
 
 
343 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.31 
 
 
350 aa  278  6e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.89 
 
 
340 aa  277  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.53 
 
 
343 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 
357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.6 
 
 
342 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001772  UDP-glucose 4-epimerase  46.27 
 
 
340 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 
313 aa  271  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.25 
 
 
342 aa  271  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5210  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.73 
 
 
341 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  46.27 
 
 
344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.89 
 
 
368 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3189  polysaccharide biosynthesis protein  45 
 
 
340 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.17 
 
 
335 aa  266  4e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  45.94 
 
 
341 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5374  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:nucleotide sugar epimerase  45.7 
 
 
377 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.38 
 
 
340 aa  263  3e-69  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.250219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.49 
 
 
298 aa  260  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3996  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 
369 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29920  NAD-dependent epimerase protein  44.88 
 
 
367 aa  258  8e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374178  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0651  NAD-dependent epimerase  44.65 
 
 
344 aa  258  1e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.562081  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.06 
 
 
362 aa  255  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.19 
 
 
333 aa  249  6e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 
309 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.21 
 
 
308 aa  240  2e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.12 
 
 
342 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.94 
 
 
311 aa  236  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.99 
 
 
324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.31 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.71 
 
 
309 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.92 
 
 
306 aa  230  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.75 
 
 
325 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 
309 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.69 
 
 
328 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.97 
 
 
323 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 
313 aa  226  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
328 aa  223  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
321 aa  222  7e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.78 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.1 
 
 
324 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.65 
 
 
310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.33 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  43.95 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.96 
 
 
318 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 
302 aa  218  1e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41 
 
 
292 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.47 
 
 
310 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 
308 aa  215  9e-55  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.27 
 
 
331 aa  215  9e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.47 
 
 
310 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  41.14 
 
 
309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.73 
 
 
310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 
310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 
310 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.47 
 
 
309 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.27 
 
 
323 aa  211  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.473487  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.9 
 
 
316 aa  209  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.93 
 
 
318 aa  209  5e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
292 aa  207  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.87 
 
 
388 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
323 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
323 aa  206  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 
305 aa  205  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.91 
 
 
310 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.58 
 
 
310 aa  204  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1394  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 
325 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
292 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.62 
 
 
334 aa  202  6e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4808  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.03 
 
 
324 aa  202  6e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.272895  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.09 
 
 
296 aa  202  6e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
306 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.4 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.85 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.58 
 
 
316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
324 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 
328 aa  198  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8500  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.58 
 
 
376 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
312 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  40 
 
 
316 aa  196  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
303 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>