More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2280 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 342 aa  713    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  79.53 
 
 		 341 aa  570  1e-161  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.07 
 
 		 340 aa  543  1e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  75.37 
 
 		 341 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0099  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.28 
 
 		 342 aa  472  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.71 
 
 		 340 aa  473  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250219 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.57 
 
 		 339 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.863846  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.79 
 
 		 357 aa  468  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.52 
 
 		 350 aa  464  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3996  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.5 
 
 		 369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.05 
 
 		 362 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3189  polysaccharide biosynthesis protein  62.61 
 
 		 340 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.53 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0651  NAD-dependent epimerase  64.58 
 
 		 344 aa  433  1e-120  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.562081  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5374  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:nucleotide sugar epimerase  62.18 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001772  UDP-glucose 4-epimerase  61.42 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.91 
 
 		 342 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  61.13 
 
 		 343 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.28 
 
 		 343 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  60.7 
 
 		 344 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29920  NAD-dependent epimerase protein  60.57 
 
 		 367 aa  422  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374178  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.58 
 
 		 343 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.48 
 
 		 342 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5210  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.8 
 
 		 341 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.19 
 
 		 327 aa  380  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.51 
 
 		 368 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.31 
 
 		 335 aa  342  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  44.75 
 
 		 319 aa  272  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.38 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.89 
 
 		 313 aa  265  7e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.14 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.25 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.77 
 
 		 304 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.44 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.45 
 
 		 314 aa  252  8.000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  41.93 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.62 
 
 		 311 aa  243  5e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.71 
 
 		 307 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.41 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.29 
 
 		 321 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 		 313 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.92 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 		 333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.68 
 
 		 325 aa  196  5.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  39.66 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.78 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.75 
 
 		 309 aa  192  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.15 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.98 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 		 316 aa  186  5e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 		 388 aa  182  6e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.37 
 
 		 318 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.77 
 
 		 316 aa  179  8e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.44 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.68 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 		 302 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 324 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.05 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 		 328 aa  172  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.7 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 292 aa  171  2e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.89 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 310 aa  169  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.45 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 		 331 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 		 309 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 		 314 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 		 292 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.65 
 
 		 324 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.2 
 
 		 324 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.83 
 
 		 335 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  34.45 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.99 
 
 		 316 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  33.54 
 
 		 337 aa  159  7e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0844  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 332 aa  158  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.139741  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 299 aa  158  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>