More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0271 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
350 aa  729    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0099  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.2 
 
 
342 aa  478  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.251032 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0248  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.91 
 
 
340 aa  464  9.999999999999999e-131  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.250219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.52 
 
 
342 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.16 
 
 
362 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2662  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.52 
 
 
341 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5374  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:nucleotide sugar epimerase  67.26 
 
 
377 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0358  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  63.93 
 
 
341 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.72 
 
 
343 aa  457  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3795  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.61 
 
 
357 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.55139  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.17 
 
 
340 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4705  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.98 
 
 
343 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.674809  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3996  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.33 
 
 
369 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3189  polysaccharide biosynthesis protein  61.4 
 
 
340 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.35 
 
 
339 aa  433  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.863846  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001772  UDP-glucose 4-epimerase  61.72 
 
 
340 aa  424  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2324  VI polysaccharide biosynthesis protein vipB/tviC  61.24 
 
 
343 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3643  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  60.29 
 
 
344 aa  423  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0827968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.58 
 
 
342 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0651  NAD-dependent epimerase  60.77 
 
 
344 aa  413  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.562081  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29920  NAD-dependent epimerase protein  57.14 
 
 
367 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0374178  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.3 
 
 
342 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.56 
 
 
343 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0359  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.51 
 
 
327 aa  378  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1202  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.58 
 
 
368 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5210  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.63 
 
 
341 aa  365  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.23 
 
 
335 aa  357  9.999999999999999e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.71 
 
 
313 aa  288  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.38 
 
 
322 aa  279  5e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  45.4 
 
 
319 aa  278  7e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.69 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.39 
 
 
313 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.31 
 
 
309 aa  268  8.999999999999999e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.08 
 
 
314 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.03 
 
 
310 aa  266  4e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.12 
 
 
311 aa  266  4e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.77 
 
 
304 aa  265  7e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  42.81 
 
 
308 aa  261  1e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  38.08 
 
 
307 aa  231  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.77 
 
 
313 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 
327 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  40.74 
 
 
298 aa  210  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
325 aa  210  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.5 
 
 
308 aa  208  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 
333 aa  206  6e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.22 
 
 
321 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.22 
 
 
321 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.42 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.57 
 
 
388 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
309 aa  199  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
309 aa  198  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 
306 aa  195  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 
310 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
308 aa  192  9e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 
310 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
328 aa  186  4e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 
310 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 
328 aa  185  9e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 
302 aa  184  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 
311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.46 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
309 aa  182  7e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
323 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
310 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
323 aa  181  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.98 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.85 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.33 
 
 
309 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
317 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
314 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
318 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 
306 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.53 
 
 
310 aa  176  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  35.11 
 
 
302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  35.8 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 
309 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.74 
 
 
304 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
331 aa  169  5e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 
308 aa  169  5e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 
329 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
315 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
324 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.73 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 
328 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
314 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
324 aa  162  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.04 
 
 
331 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
345 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.170063 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  33.74 
 
 
337 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
327 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
327 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>