More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1942 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.33 
 
 		 318 aa  334  1e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.16 
 
 		 305 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.51 
 
 		 310 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.91 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 		 292 aa  281  9e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.58 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.16 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.48 
 
 		 292 aa  275  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.84 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.96 
 
 		 292 aa  271  8.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.42 
 
 		 302 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.53 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.56 
 
 		 313 aa  266  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.12 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.53 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.01 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 		 310 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 		 310 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 		 310 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.86 
 
 		 304 aa  225  6e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.41 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.49 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 		 330 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.5 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.03 
 
 		 306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 		 311 aa  210  3e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.5 
 
 		 307 aa  209  3e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8322  UDP-glucose 4-epimerase  38.89 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.23 
 
 		 333 aa  206  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.92 
 
 		 331 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13665  UDP-glucose 4-epimerase galE1  38.34 
 
 		 314 aa  204  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0159869 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 		 328 aa  203  3e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.07 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0739  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.83 
 
 		 326 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.26 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 310 aa  195  9e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.29 
 
 		 304 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.93 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.53 
 
 		 299 aa  192  7e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  36.49 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.83 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  39.02 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.54 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.52 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  36.33 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.79 
 
 		 316 aa  181  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 314 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.5 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.62 
 
 		 313 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 		 313 aa  178  8e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3068  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.46 
 
 		 309 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.88 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.26 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 373 aa  175  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.43 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.18 
 
 		 310 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.67 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0271  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.27 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1033  putative epimerase  39.03 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  38.51 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  32.69 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 		 342 aa  168  9e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 		 308 aa  168  9e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 408 aa  167  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.02 
 
 		 335 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.44 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3189  polysaccharide biosynthesis protein  34.38 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.03 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.13 
 
 		 335 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 320 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  32.91 
 
 		 593 aa  165  8e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.63 
 
 		 336 aa  165  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000399652  decreased coverage  0.0000579035 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>