More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3207 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
315 aa  658    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.04 
 
 
314 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.34 
 
 
320 aa  474  1e-133  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  66.99 
 
 
310 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.24 
 
 
310 aa  193  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 
309 aa  192  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
309 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
313 aa  186  5e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  34.71 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 
310 aa  178  8e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 
309 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  34.71 
 
 
302 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.11 
 
 
296 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 
306 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.67 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.88 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 
331 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.48 
 
 
305 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.22 
 
 
292 aa  170  2e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 
292 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.84 
 
 
327 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 
292 aa  170  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 
333 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.12 
 
 
324 aa  168  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
328 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
317 aa  168  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.44 
 
 
317 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
345 aa  167  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
316 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
302 aa  167  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.02 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1582  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000491095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
310 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 
326 aa  166  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35 
 
 
310 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.22 
 
 
328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
330 aa  163  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
312 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.58 
 
 
310 aa  162  7e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.98 
 
 
344 aa  161  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.66 
 
 
309 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
317 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3613  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
332 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.299125 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  34.98 
 
 
345 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13665  UDP-glucose 4-epimerase galE1  35.14 
 
 
314 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0159869 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.53 
 
 
301 aa  160  3e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.2 
 
 
326 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 
314 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 
311 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.75 
 
 
312 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.51 
 
 
322 aa  158  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1375  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.23 
 
 
322 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
314 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
328 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.16 
 
 
318 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6506  UDP-glucose 4-epimerase  33.75 
 
 
326 aa  156  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
303 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
310 aa  155  8e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
299 aa  155  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
316 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
343 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
322 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
353 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.92 
 
 
310 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.09 
 
 
323 aa  153  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.49 
 
 
311 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1337  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.28 
 
 
322 aa  151  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.120656  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
313 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  33.02 
 
 
323 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
308 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.06 
 
 
307 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4289  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.53 
 
 
353 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1137  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.96 
 
 
322 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1111  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.96 
 
 
322 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1230  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.96 
 
 
322 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.44 
 
 
322 aa  150  4e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.17 
 
 
330 aa  150  4e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3843  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.93 
 
 
346 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
302 aa  149  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
330 aa  149  7e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
321 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.18 
 
 
336 aa  149  8e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
314 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1298  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.65 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1269  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.46 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.281724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.91 
 
 
354 aa  148  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.71 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.13 
 
 
346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  32.52 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>