More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3579 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  96.21 
 
 
317 aa  636    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
317 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.61 
 
 
316 aa  595  1e-169  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  80.13 
 
 
318 aa  539  9.999999999999999e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.08 
 
 
318 aa  488  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.19 
 
 
330 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.61 
 
 
329 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.61 
 
 
329 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.26 
 
 
326 aa  445  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.26 
 
 
313 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.24 
 
 
322 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  68.3 
 
 
326 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  67.97 
 
 
326 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.3 
 
 
327 aa  428  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.31 
 
 
316 aa  429  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.92 
 
 
316 aa  425  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02955  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  64.38 
 
 
339 aa  420  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.29 
 
 
313 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.186347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.44 
 
 
312 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60 
 
 
314 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.39 
 
 
325 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.46 
 
 
315 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60 
 
 
319 aa  381  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.04 
 
 
318 aa  383  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.78 
 
 
312 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0395145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2009  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.78 
 
 
312 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.28 
 
 
323 aa  374  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.15102 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60 
 
 
360 aa  372  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.06 
 
 
308 aa  368  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.74 
 
 
311 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.88 
 
 
311 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.31 
 
 
313 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  58.52 
 
 
311 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 
321 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.28 
 
 
329 aa  363  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.23 
 
 
314 aa  360  1e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  59.87 
 
 
313 aa  360  2e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.68 
 
 
311 aa  360  2e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.37 
 
 
318 aa  358  5e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.98 
 
 
311 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.91 
 
 
315 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.31 
 
 
313 aa  357  1.9999999999999998e-97  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.48 
 
 
318 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.95 
 
 
318 aa  356  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.66 
 
 
313 aa  355  3.9999999999999996e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  56.41 
 
 
326 aa  355  5.999999999999999e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  56.91 
 
 
317 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  56.49 
 
 
325 aa  353  2e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.91 
 
 
317 aa  353  2e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.09 
 
 
309 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.7 
 
 
336 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  55.24 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  55.24 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3245  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.38 
 
 
331 aa  352  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.89 
 
 
324 aa  352  5e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 
346 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.19 
 
 
312 aa  351  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 
308 aa  351  8e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.81 
 
 
318 aa  351  8.999999999999999e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 
311 aa  351  8.999999999999999e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.31 
 
 
313 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.19 
 
 
320 aa  351  1e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.6 
 
 
321 aa  350  1e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.16 
 
 
330 aa  350  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  55.45 
 
 
337 aa  350  2e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  58.31 
 
 
316 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.82 
 
 
315 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  55.45 
 
 
337 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.42 
 
 
310 aa  350  2e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.33 
 
 
320 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.81 
 
 
308 aa  350  2e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 
311 aa  349  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.63 
 
 
313 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 
347 aa  348  7e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  52.06 
 
 
514 aa  347  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.59 
 
 
319 aa  346  4e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.92 
 
 
322 aa  345  5e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.34 
 
 
309 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  56.86 
 
 
350 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.78 
 
 
330 aa  345  7e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.31 
 
 
313 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.1 
 
 
325 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.14 
 
 
325 aa  342  5e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 
340 aa  342  7e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.19 
 
 
315 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.66 
 
 
340 aa  342  7e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.84 
 
 
311 aa  340  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.7 
 
 
314 aa  340  1e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.49 
 
 
318 aa  341  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.08 
 
 
312 aa  341  1e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.37 
 
 
331 aa  340  2e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.34 
 
 
342 aa  340  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.4 
 
 
311 aa  340  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.95 
 
 
319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.35 
 
 
341 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
343 aa  339  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.8 
 
 
326 aa  338  5.9999999999999996e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.29 
 
 
330 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.746716  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  53.72 
 
 
311 aa  336  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  55.37 
 
 
329 aa  335  5e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883785  normal  0.146231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>