More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1858 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
318 aa  654    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.4 
 
 
316 aa  494  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  75.08 
 
 
317 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  74.76 
 
 
317 aa  484  1e-136  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.1 
 
 
329 aa  472  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.1 
 
 
329 aa  473  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.79 
 
 
330 aa  472  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.9 
 
 
326 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.65 
 
 
318 aa  464  9.999999999999999e-131  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.24 
 
 
326 aa  464  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  71.57 
 
 
326 aa  465  9.999999999999999e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.9 
 
 
316 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.97 
 
 
313 aa  458  9.999999999999999e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02955  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  68.06 
 
 
339 aa  457  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.51 
 
 
322 aa  449  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.87 
 
 
327 aa  446  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.64 
 
 
316 aa  443  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.29 
 
 
325 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.38 
 
 
318 aa  408  1e-113  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.49 
 
 
319 aa  410  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.42 
 
 
313 aa  402  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.31 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.15102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.12 
 
 
315 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.61 
 
 
329 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.84 
 
 
311 aa  395  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.49 
 
 
313 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.186347 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.54 
 
 
313 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.62 
 
 
311 aa  392  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.39 
 
 
360 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.32 
 
 
311 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.35 
 
 
311 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.66 
 
 
312 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.12 
 
 
311 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2009  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.33 
 
 
312 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.59 
 
 
312 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.87 
 
 
310 aa  381  1e-105  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.42 
 
 
314 aa  381  1e-105  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.54 
 
 
330 aa  383  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.33 
 
 
312 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0395145  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.31 
 
 
321 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.93 
 
 
314 aa  378  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.58 
 
 
309 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.12 
 
 
313 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.41 
 
 
340 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.79 
 
 
313 aa  371  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  56.91 
 
 
317 aa  371  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.13 
 
 
318 aa  373  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.66 
 
 
318 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.19 
 
 
316 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.41 
 
 
340 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  56.82 
 
 
311 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.77 
 
 
315 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.91 
 
 
315 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3245  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.96 
 
 
331 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.69 
 
 
322 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.31 
 
 
308 aa  368  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.31 
 
 
313 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.99 
 
 
312 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.16 
 
 
311 aa  368  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.35 
 
 
315 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.87 
 
 
318 aa  365  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
318 aa  365  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.37 
 
 
325 aa  364  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.78 
 
 
321 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.03 
 
 
319 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.05 
 
 
325 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.42 
 
 
331 aa  364  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.84 
 
 
308 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.15 
 
 
313 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.81 
 
 
341 aa  362  3e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.84 
 
 
308 aa  362  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  57.47 
 
 
350 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.17 
 
 
318 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.23 
 
 
324 aa  361  1e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.31 
 
 
316 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.27 
 
 
317 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.87 
 
 
336 aa  359  4e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  55.34 
 
 
326 aa  359  4e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57 
 
 
330 aa  358  5e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  55.37 
 
 
325 aa  358  6e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  55.27 
 
 
311 aa  358  6e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.55 
 
 
346 aa  358  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  54.95 
 
 
340 aa  358  7e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  54.95 
 
 
340 aa  358  7e-98  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.48 
 
 
314 aa  358  9e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  55.99 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  55.99 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.7 
 
 
342 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.41 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  54.49 
 
 
313 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.19 
 
 
347 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.92 
 
 
311 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.72 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.55 
 
 
311 aa  356  2.9999999999999997e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.14 
 
 
326 aa  355  3.9999999999999996e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  56.39 
 
 
329 aa  355  6.999999999999999e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883785  normal  0.146231 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  54.84 
 
 
320 aa  354  7.999999999999999e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  54.9 
 
 
316 aa  354  1e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  54.37 
 
 
348 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1288  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  54.37 
 
 
348 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>