More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1223 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
312 aa  652    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.36 
 
 
312 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.55 
 
 
313 aa  467  9.999999999999999e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  70.68 
 
 
311 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.4 
 
 
311 aa  461  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.38 
 
 
311 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.73 
 
 
311 aa  461  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.51 
 
 
310 aa  455  1e-127  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.87 
 
 
313 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  68.98 
 
 
311 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.45 
 
 
318 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.92 
 
 
321 aa  440  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.06 
 
 
319 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.36 
 
 
311 aa  438  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  66.77 
 
 
320 aa  436  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.37 
 
 
315 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  62.7 
 
 
317 aa  431  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.7 
 
 
315 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.38 
 
 
309 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.28 
 
 
340 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.28 
 
 
340 aa  431  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.51 
 
 
313 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.18 
 
 
313 aa  429  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.74 
 
 
318 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.74 
 
 
315 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.49 
 
 
316 aa  428  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.95 
 
 
342 aa  428  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.94 
 
 
336 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  63.46 
 
 
331 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.06 
 
 
317 aa  425  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.06 
 
 
324 aa  422  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.64 
 
 
348 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.49 
 
 
314 aa  421  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.64 
 
 
348 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.28 
 
 
318 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.86 
 
 
313 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.64 
 
 
348 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2263  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.64 
 
 
348 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171141  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.64 
 
 
348 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1288  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.64 
 
 
348 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.86 
 
 
330 aa  421  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.75 
 
 
343 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.64 
 
 
348 aa  423  1e-117  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  62.83 
 
 
350 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.29 
 
 
318 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.75 
 
 
326 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.06 
 
 
341 aa  420  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.26 
 
 
320 aa  418  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  63.28 
 
 
314 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.11 
 
 
322 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.42 
 
 
346 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.42 
 
 
347 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.29 
 
 
318 aa  416  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.71 
 
 
308 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.96 
 
 
311 aa  411  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  63.23 
 
 
337 aa  410  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  62.66 
 
 
326 aa  409  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.29 
 
 
319 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.14 
 
 
348 aa  410  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  63.23 
 
 
337 aa  410  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.77 
 
 
319 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.8 
 
 
313 aa  405  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  61.81 
 
 
311 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.56 
 
 
321 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.22 
 
 
316 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.97 
 
 
330 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.03 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.14 
 
 
348 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.03 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.69 
 
 
348 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115759  hitchhiker  0.00412284 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  59.42 
 
 
340 aa  395  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.24 
 
 
309 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  59.42 
 
 
340 aa  395  1e-109  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.03 
 
 
348 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.0540302 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.73 
 
 
308 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.73 
 
 
308 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.03 
 
 
348 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.03 
 
 
349 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.03 
 
 
349 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.03 
 
 
348 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.71 
 
 
333 aa  389  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.39 
 
 
311 aa  389  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  58.69 
 
 
325 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  60.4 
 
 
311 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  57.74 
 
 
514 aa  382  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  58.5 
 
 
319 aa  384  1e-105  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  57.42 
 
 
316 aa  380  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  58.58 
 
 
313 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4001  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.14 
 
 
340 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.152029  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.27 
 
 
340 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000594661  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.63 
 
 
335 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0439  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.77 
 
 
340 aa  371  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.99 
 
 
318 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.1 
 
 
330 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1505  dTDP-glucose 4-6-dehydratase  57.19 
 
 
331 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.9 
 
 
346 aa  364  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14001  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  57.76 
 
 
316 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.23 
 
 
346 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1264  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.53 
 
 
365 aa  363  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.561113  normal  0.0105388 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  54.37 
 
 
410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>