More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41531 on replicon NC_011699
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
514 aa  1068    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG02560  UDP-glucuronic acid decarboxylase Uxs1p  57.66 
 
 
410 aa  433  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.27 
 
 
313 aa  435  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.72 
 
 
321 aa  432  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  65.15 
 
 
311 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.55 
 
 
311 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  62.94 
 
 
325 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  64.47 
 
 
311 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.23 
 
 
311 aa  425  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.66 
 
 
311 aa  424  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.07 
 
 
309 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.69 
 
 
310 aa  425  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.76 
 
 
319 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.58 
 
 
308 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.38 
 
 
318 aa  421  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  62.78 
 
 
311 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.14 
 
 
330 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.61 
 
 
313 aa  419  1e-116  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.58 
 
 
308 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0189  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  61.24 
 
 
316 aa  417  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.496773  decreased coverage  0.00806939 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  62.22 
 
 
326 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.66 
 
 
318 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.64 
 
 
312 aa  415  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.58 
 
 
343 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.32 
 
 
316 aa  409  1e-113  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  60.13 
 
 
317 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.81 
 
 
315 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.44 
 
 
311 aa  410  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.44 
 
 
340 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.73 
 
 
336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.84 
 
 
315 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.44 
 
 
340 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.06 
 
 
311 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.18 
 
 
320 aa  404  1e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  60.39 
 
 
319 aa  405  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  60.26 
 
 
331 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.9 
 
 
315 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.54 
 
 
322 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.11 
 
 
317 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  59.87 
 
 
313 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.4 
 
 
308 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  58.97 
 
 
340 aa  402  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  58.97 
 
 
340 aa  402  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.46 
 
 
342 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.91 
 
 
321 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.81 
 
 
320 aa  400  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.97 
 
 
316 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  60.33 
 
 
311 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5784  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.03 
 
 
319 aa  397  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  0.0304013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4668  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.46 
 
 
324 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.446281  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1680  putative nucleoside-diphosphate sugar epimerase  58.17 
 
 
318 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.178648  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.88 
 
 
346 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.79 
 
 
347 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.62 
 
 
341 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03941  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  58.17 
 
 
318 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.873071  normal  0.0436557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.15 
 
 
314 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.83 
 
 
348 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.64 
 
 
318 aa  393  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.88 
 
 
318 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.17 
 
 
314 aa  393  1e-108  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14001  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  58.39 
 
 
316 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0542  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.88 
 
 
337 aa  392  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.51 
 
 
318 aa  391  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0473  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.88 
 
 
337 aa  392  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.15 
 
 
313 aa  389  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.19 
 
 
309 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.87 
 
 
326 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235622  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1978  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.56 
 
 
348 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0857049  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.71 
 
 
333 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1378  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.56 
 
 
348 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280113  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.74 
 
 
312 aa  382  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.56 
 
 
348 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.47827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1288  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.56 
 
 
348 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.56 
 
 
348 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.56 
 
 
348 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2263  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  57.56 
 
 
348 aa  384  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.171141  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.01 
 
 
349 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  59.67 
 
 
350 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.1 
 
 
333 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134293 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.27 
 
 
319 aa  382  1e-104  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.37 
 
 
311 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.01 
 
 
349 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.99 
 
 
348 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.120111  normal  0.224068 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.28 
 
 
333 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.49 
 
 
330 aa  377  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.47 
 
 
348 aa  375  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115759  hitchhiker  0.00412284 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.87 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.82 
 
 
348 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.82 
 
 
348 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6047  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.82 
 
 
348 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.438767  normal  0.0540302 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.58 
 
 
313 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.92 
 
 
313 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  54.37 
 
 
345 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.177339  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1794  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.37 
 
 
345 aa  360  3e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.381286  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.25 
 
 
335 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.31 
 
 
313 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0244  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.05 
 
 
346 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.218972  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.24 
 
 
346 aa  352  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.794763  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.57 
 
 
335 aa  352  7e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.39 
 
 
335 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984482  normal  0.365956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>