More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2462 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
323 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0431145  normal  0.15102 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  77.27 
 
 
329 aa  484  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0464  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.44 
 
 
325 aa  457  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.03 
 
 
316 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.56 
 
 
319 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1858  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.31 
 
 
318 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3245  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.19 
 
 
331 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.221391 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1294  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.19 
 
 
360 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.26434  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1512  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.11 
 
 
316 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.28 
 
 
317 aa  374  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.84 
 
 
330 aa  375  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.39 
 
 
316 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.556452  hitchhiker  0.000650625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.64 
 
 
317 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.03 
 
 
322 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.42 
 
 
326 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  57.42 
 
 
326 aa  369  1e-101  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.31 
 
 
315 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02955  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  56.72 
 
 
339 aa  365  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.7 
 
 
330 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.33 
 
 
327 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.45 
 
 
329 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.45 
 
 
329 aa  363  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.9 
 
 
313 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.186347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11280  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  57.76 
 
 
329 aa  362  4e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883785  normal  0.146231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3525  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.33 
 
 
326 aa  362  4e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.87 
 
 
318 aa  362  6e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.35 
 
 
313 aa  360  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1955  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.09 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0684106  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.09 
 
 
312 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0395145  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2009  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.09 
 
 
312 aa  355  5.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1611  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.05 
 
 
313 aa  342  5e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.709629  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.51 
 
 
325 aa  340  2.9999999999999998e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.13 
 
 
314 aa  339  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.89 
 
 
318 aa  339  4e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.87 
 
 
325 aa  338  9e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.85 
 
 
319 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3791  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.07 
 
 
313 aa  334  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.05 
 
 
314 aa  329  4e-89  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.167111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.53 
 
 
318 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00954538 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
312 aa  325  5e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1726  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.73 
 
 
310 aa  324  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.453654  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.61 
 
 
311 aa  324  1e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14221  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  49.36 
 
 
311 aa  324  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.84912  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.23 
 
 
313 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1431  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.44 
 
 
313 aa  322  6e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000855956  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2307  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.43 
 
 
311 aa  322  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00124145  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3252  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.38 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0363049  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33309  predicted protein  51.58 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29801  predicted protein  51.58 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.8 
 
 
340 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.8 
 
 
340 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0814825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.1 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.376158  normal  0.0242286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.46 
 
 
311 aa  319  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3186  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.28 
 
 
318 aa  319  5e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.46 
 
 
316 aa  318  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.301245  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.27 
 
 
313 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1165  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  51.6 
 
 
320 aa  317  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0499982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.12 
 
 
318 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000151711  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  50.97 
 
 
326 aa  316  3e-85  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.97 
 
 
311 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.366265  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6227  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.85 
 
 
347 aa  316  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131148 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  49.51 
 
 
311 aa  315  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.39 
 
 
321 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.23 
 
 
341 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298599  normal  0.0394755 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4417  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.92 
 
 
336 aa  314  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0129  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
322 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0562  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3556  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.12 
 
 
321 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3769  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.24 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0261  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.16 
 
 
311 aa  313  1.9999999999999998e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.370218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1140  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 
312 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0262  sugar nucleotide dehydratase  51.62 
 
 
317 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129808  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2802  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.47 
 
 
317 aa  312  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.06 
 
 
346 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4391  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  50.97 
 
 
350 aa  310  2e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626317  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.48 
 
 
318 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.35 
 
 
309 aa  310  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
315 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.380397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  50.16 
 
 
311 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0782  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.8 
 
 
316 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.182086  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4166  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.8 
 
 
315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.08 
 
 
322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3060  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  49.23 
 
 
331 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0392933  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.69 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.32 
 
 
335 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984482  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.04 
 
 
320 aa  306  3e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3681  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.14 
 
 
343 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0230856  normal  0.593918 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.66 
 
 
309 aa  306  4.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.27 
 
 
311 aa  306  4.0000000000000004e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.747671  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6481  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.84 
 
 
342 aa  305  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3673  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.94 
 
 
348 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0212169 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1149  dTDP-glucose 46-dehydratase  49.35 
 
 
325 aa  305  8.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.985297 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.23 
 
 
330 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000230956 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1566  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
319 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.13324  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41531  nad-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 
514 aa  304  1.0000000000000001e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.71 
 
 
340 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.000000594661  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.48 
 
 
308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3158  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  49.04 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0477125  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3029  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  49.04 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.965327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>