More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1969 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
310 aa  619  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  48.84 
 
 
302 aa  294  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  48.84 
 
 
318 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.37 
 
 
309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.04 
 
 
309 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.56 
 
 
305 aa  276  4e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.02 
 
 
310 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.81 
 
 
296 aa  264  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.82 
 
 
292 aa  262  4e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.35 
 
 
306 aa  259  4e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.8 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 
313 aa  259  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.18 
 
 
311 aa  257  2e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.81 
 
 
292 aa  257  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.05 
 
 
302 aa  255  8e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.89 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.8 
 
 
314 aa  252  6e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.04 
 
 
310 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.33 
 
 
309 aa  242  6e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
310 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.42 
 
 
310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.02 
 
 
312 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.18 
 
 
303 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.09 
 
 
304 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.51 
 
 
330 aa  228  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.97 
 
 
309 aa  224  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
322 aa  218  7.999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.61 
 
 
311 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 
299 aa  216  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.83 
 
 
334 aa  212  7e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  37.62 
 
 
307 aa  211  2e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.14 
 
 
306 aa  208  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8322  UDP-glucose 4-epimerase  42.48 
 
 
314 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.9 
 
 
309 aa  205  7e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.2 
 
 
313 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.86 
 
 
310 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.9 
 
 
331 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.05 
 
 
333 aa  202  6e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
310 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42 
 
 
299 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
313 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.5 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  35.99 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.05 
 
 
328 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0739  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.21 
 
 
326 aa  194  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13665  UDP-glucose 4-epimerase galE1  38.96 
 
 
314 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0159869 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 
313 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 
328 aa  193  4e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  38.36 
 
 
332 aa  193  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  39 
 
 
309 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 
323 aa  192  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.39 
 
 
323 aa  192  9e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.79 
 
 
322 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.95 
 
 
331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.46 
 
 
285 aa  189  4e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.32 
 
 
332 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.86 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.49 
 
 
328 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 
312 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  35.31 
 
 
319 aa  187  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 
304 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.59 
 
 
306 aa  187  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 
325 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.33 
 
 
309 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 
310 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
309 aa  185  9e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.54 
 
 
310 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.21 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.48 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.24 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.51 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 
308 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.45 
 
 
312 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  38.46 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.26 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.84 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.7 
 
 
307 aa  179  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  38.24 
 
 
336 aa  179  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 
318 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.74 
 
 
310 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 
316 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.07 
 
 
301 aa  175  9e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  37.38 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.09 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
339 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  37.07 
 
 
337 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  36.5 
 
 
332 aa  172  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.66 
 
 
321 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.37 
 
 
315 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  34.27 
 
 
321 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2411  UDP-galactose 4-epimerase  35.74 
 
 
333 aa  171  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.016358  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  34.98 
 
 
320 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 
321 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 
312 aa  170  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>