More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0885 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 312 aa  635    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  84.89 
 
 		 314 aa  547  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.23 
 
 		 311 aa  457  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.39 
 
 		 308 aa  431  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.35 
 
 		 301 aa  421  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.22 
 
 		 325 aa  335  7e-91  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.87 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.02 
 
 		 315 aa  296  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.17 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.48 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.97 
 
 		 311 aa  266  5e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.41 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.99 
 
 		 319 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.13 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.12 
 
 		 310 aa  245  6.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.61 
 
 		 306 aa  242  6e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  45.75 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.97 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.3 
 
 		 313 aa  225  8e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.78 
 
 		 310 aa  223  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.37 
 
 		 324 aa  219  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.8 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.19 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.12 
 
 		 313 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.67 
 
 		 309 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  37.26 
 
 		 317 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 331 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  34.71 
 
 		 302 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.48 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.33 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.56 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.26 
 
 		 309 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 303 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.58 
 
 		 310 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  31.86 
 
 		 318 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 306 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.94 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  32.62 
 
 		 308 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 		 324 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.97 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 		 296 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.38 
 
 		 344 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.38 
 
 		 345 aa  152  8.999999999999999e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.75 
 
 		 292 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 		 313 aa  149  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  29.39 
 
 		 307 aa  149  6e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.72 
 
 		 327 aa  149  7e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 306 aa  148  9e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  32.29 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.03 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.22 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 317 aa  145  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.38 
 
 		 309 aa  146  6e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.61 
 
 		 292 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 		 331 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  34.15 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  34.39 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  29.72 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.31 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.6 
 
 		 322 aa  142  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.43 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.44 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4020  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4588  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.09 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1609  UDP-glucose 4-epimerase  33.01 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3291  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  30.65 
 
 		 329 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  31.51 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  34.39 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  30.94 
 
 		 323 aa  139  7.999999999999999e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1809  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 		 302 aa  139  7.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  30.27 
 
 		 336 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  32.91 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 		 593 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  31.68 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  32.51 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 		 346 aa  138  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>