More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0448 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  68.18 
 
 
310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.49 
 
 
313 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.62 
 
 
310 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  57.79 
 
 
308 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.56 
 
 
316 aa  345  7e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.56 
 
 
317 aa  344  8.999999999999999e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.42 
 
 
319 aa  338  9e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.05 
 
 
317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.08 
 
 
319 aa  312  4.999999999999999e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.2 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.86 
 
 
309 aa  281  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.39 
 
 
310 aa  278  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.3 
 
 
325 aa  267  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.01 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.39 
 
 
313 aa  265  8e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  42.86 
 
 
312 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.62 
 
 
321 aa  250  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 
306 aa  243  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42 
 
 
324 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.23 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.97 
 
 
312 aa  237  2e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.81 
 
 
311 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.32 
 
 
314 aa  224  1e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.03 
 
 
308 aa  220  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.9 
 
 
331 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  38.78 
 
 
317 aa  217  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.22 
 
 
313 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
317 aa  195  8.000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
296 aa  155  7e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
292 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
292 aa  151  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
302 aa  133  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
309 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
309 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
333 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.98 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.42 
 
 
321 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 
309 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
331 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
305 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.77 
 
 
309 aa  126  5e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
313 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
311 aa  125  6e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  29.97 
 
 
328 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
317 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 
309 aa  124  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
309 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
334 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
314 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.59 
 
 
318 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
309 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 
331 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
306 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
328 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.39 
 
 
343 aa  122  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0337048 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  27.99 
 
 
308 aa  122  8e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
316 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1622  UDP-glucose 4-epimerase  32.43 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222296  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.16 
 
 
298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.13 
 
 
312 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 
313 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
327 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
328 aa  119  3.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.82 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.58 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132998  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.84 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  31.44 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.72 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  29.89 
 
 
327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.3 
 
 
324 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.29 
 
 
299 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  33.66 
 
 
319 aa  117  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
310 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
318 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
308 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.14 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
408 aa  116  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.97 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
310 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  30.87 
 
 
327 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
328 aa  116  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
315 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
314 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.11 
 
 
317 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>