More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1334 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  100 
 
 		 317 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.39 
 
 		 317 aa  245  6.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 		 319 aa  241  7.999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.12 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.25 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  40.45 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 		 324 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  37.86 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.6 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.2 
 
 		 312 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.78 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39 
 
 		 315 aa  208  1e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.74 
 
 		 313 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.1 
 
 		 311 aa  205  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.17 
 
 		 325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 310 aa  199  6e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.26 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.72 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 		 314 aa  188  1e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.81 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.19 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 		 310 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 		 331 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.79 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.16 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  35.26 
 
 		 318 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  29.94 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 		 315 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 		 343 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.28 
 
 		 324 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.19 
 
 		 307 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2234  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 		 317 aa  113  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8322  UDP-glucose 4-epimerase  29.11 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 		 310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 309 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.68 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14001  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.16 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.79 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  30.79 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 313 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2118  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.292316  normal  0.0790503 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.99 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.01 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.84 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.46913  normal  0.0352982 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.97 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 		 312 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  28.48 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.93 
 
 		 313 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  26.65 
 
 		 327 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1815  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  27.67 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.437537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.68 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0893  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0571  UDP-glucose 4-epimerase  30.18 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.16 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 		 333 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.427857  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.76 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5610  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.67 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.32 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26091  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  25.47 
 
 		 313 aa  99.8  5e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  27.67 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0919  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.97 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0917118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  27.67 
 
 		 345 aa  99.8  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>