More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0174 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
306 aa  634    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.61 
 
 
311 aa  373  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.18 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 
325 aa  260  2e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.33 
 
 
317 aa  256  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.28 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  43 
 
 
308 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
317 aa  246  3e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.38 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.48 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.62 
 
 
311 aa  242  5e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.61 
 
 
312 aa  242  6e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.83 
 
 
319 aa  237  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.92 
 
 
314 aa  238  1e-61  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.04 
 
 
310 aa  232  6e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 
319 aa  230  2e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.01 
 
 
308 aa  228  9e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.16 
 
 
313 aa  228  1e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.79 
 
 
309 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.87 
 
 
310 aa  209  6e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
313 aa  207  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  37.66 
 
 
312 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  38.72 
 
 
317 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.98 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.74 
 
 
321 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.66 
 
 
313 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36 
 
 
292 aa  159  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
317 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
302 aa  145  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.41 
 
 
345 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.41 
 
 
344 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
292 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
309 aa  138  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
296 aa  136  5e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.68 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2514  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.577574  normal  0.786667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
333 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
317 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  31.21 
 
 
329 aa  129  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.01 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  30.39 
 
 
308 aa  127  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3228  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  30.42 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  32.5 
 
 
319 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
324 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.09 
 
 
318 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
299 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
327 aa  125  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  31.65 
 
 
328 aa  125  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.7 
 
 
314 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 
328 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
316 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
325 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
312 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
304 aa  123  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
311 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.85 
 
 
304 aa  123  5e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  30.82 
 
 
316 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.43 
 
 
328 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.03 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.66 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
318 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
308 aa  119  7.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.56373  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
314 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.76 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.06 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.77 
 
 
304 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.76 
 
 
313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  30.45 
 
 
328 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.84 
 
 
315 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.39 
 
 
310 aa  115  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  30.6 
 
 
328 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.85 
 
 
324 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
354 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  30.84 
 
 
328 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.62 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  29.92 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.68 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.46 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3691  UDP-glucose 4-epimerase  27.48 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.22 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3265  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
372 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.791109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4205  UDP-glucose 4-epimerase  31.58 
 
 
318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>