More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0148 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
317 aa  650    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.84 
 
 
319 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.31 
 
 
316 aa  418  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.68 
 
 
317 aa  402  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.31 
 
 
310 aa  368  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.96 
 
 
319 aa  370  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  57.23 
 
 
308 aa  362  3e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.66 
 
 
310 aa  353  2e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.77 
 
 
315 aa  339  4e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.05 
 
 
308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.97 
 
 
313 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.56 
 
 
325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  44.37 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 
313 aa  301  1e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 
311 aa  291  1e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.1 
 
 
310 aa  277  1e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.38 
 
 
314 aa  271  8.000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.17 
 
 
312 aa  271  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.27 
 
 
311 aa  263  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
309 aa  261  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.63 
 
 
324 aa  260  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45 
 
 
308 aa  258  9e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.33 
 
 
306 aa  256  3e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 
311 aa  247  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.44 
 
 
331 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  40.25 
 
 
317 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.8 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.58 
 
 
321 aa  227  2e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
317 aa  202  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.13 
 
 
296 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
292 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.48 
 
 
310 aa  160  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
304 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
302 aa  160  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 
313 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.55 
 
 
333 aa  158  9e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.26 
 
 
311 aa  158  1e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 
309 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 
313 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 
327 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.51 
 
 
309 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.88 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
292 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
320 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.43 
 
 
309 aa  152  8e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
314 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.55 
 
 
331 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.21 
 
 
328 aa  150  4e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
303 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  31.31 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
331 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
314 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.36 
 
 
310 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
309 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 
321 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
306 aa  143  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 
321 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
313 aa  143  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  32.8 
 
 
302 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
329 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 
310 aa  142  8e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.57 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.46 
 
 
304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  31.95 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.55 
 
 
314 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
306 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.36 
 
 
312 aa  140  3.9999999999999997e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  30.67 
 
 
327 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
310 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
334 aa  139  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
317 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
313 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
310 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  36.94 
 
 
309 aa  137  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
397 aa  137  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 
306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
310 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.02 
 
 
310 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
315 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  31.21 
 
 
332 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.4 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
308 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
593 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
324 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
343 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18701  predicted protein  31.25 
 
 
376 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00776601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  28.93 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>