More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0204 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  100 
 
 
312 aa  638    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  86.26 
 
 
313 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
317 aa  307  2.0000000000000002e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.45 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  45.54 
 
 
316 aa  299  4e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.42 
 
 
315 aa  291  7e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.08 
 
 
319 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.26 
 
 
317 aa  279  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  43.97 
 
 
308 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 
310 aa  273  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 
313 aa  269  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
308 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.18 
 
 
310 aa  255  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.88 
 
 
311 aa  255  8e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.69 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.13 
 
 
325 aa  241  9e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.19 
 
 
324 aa  232  7.000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.38 
 
 
331 aa  229  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.88 
 
 
313 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  40.2 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
312 aa  211  1e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.32 
 
 
308 aa  208  9e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
317 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
306 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.32 
 
 
311 aa  204  2e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.99 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.51 
 
 
314 aa  200  3e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.59 
 
 
301 aa  199  6e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.14 
 
 
311 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.18 
 
 
310 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.18 
 
 
314 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.15 
 
 
312 aa  176  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.7 
 
 
309 aa  175  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 
310 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.25 
 
 
310 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.83 
 
 
310 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
292 aa  168  9e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.72 
 
 
306 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.04 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  41.38 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.11 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.16 
 
 
309 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
292 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
292 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  37.33 
 
 
326 aa  160  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 
314 aa  159  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1033  putative epimerase  41 
 
 
309 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.76 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
305 aa  153  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.46 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.26 
 
 
310 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 
328 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
312 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1547  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 
312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.121163  normal  0.417102 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
327 aa  146  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.55 
 
 
307 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  35.46 
 
 
302 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
313 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
368 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.850115  normal  0.207226 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  33.75 
 
 
327 aa  142  6e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0739  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
326 aa  142  6e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.109872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
310 aa  142  7e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 
328 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
309 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
309 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.04 
 
 
318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.96 
 
 
313 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
304 aa  140  3e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.18 
 
 
316 aa  140  3e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.11 
 
 
298 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 
312 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 
308 aa  139  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
328 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
333 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.56 
 
 
325 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 
306 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  30.84 
 
 
332 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.07 
 
 
331 aa  136  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3036  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
334 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0768033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.45 
 
 
309 aa  136  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
408 aa  135  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
397 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.34 
 
 
328 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.43 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.39 
 
 
313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  30.72 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  32.59 
 
 
593 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.68 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
314 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.81 
 
 
388 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
303 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  32.09 
 
 
308 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>