More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0280 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 319 aa  657    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.26 
 
 		 316 aa  389  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  60.45 
 
 		 319 aa  390  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.69 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.96 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.92 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.77 
 
 		 310 aa  332  4e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.27 
 
 		 313 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.33 
 
 		 310 aa  324  1e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  51.27 
 
 		 308 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.08 
 
 		 308 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.88 
 
 		 310 aa  293  2e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  48.08 
 
 		 312 aa  291  1e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.78 
 
 		 309 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.87 
 
 		 313 aa  272  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.48 
 
 		 312 aa  270  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 		 311 aa  263  2e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.76 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.86 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.6 
 
 		 311 aa  254  9e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.77 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.97 
 
 		 314 aa  251  8.000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.73 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.68 
 
 		 324 aa  249  6e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.34 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.91 
 
 		 301 aa  245  9e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  39.94 
 
 		 317 aa  241  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 		 306 aa  230  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.99 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.8 
 
 		 317 aa  208  8e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.49 
 
 		 311 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 292 aa  146  6e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.99 
 
 		 292 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 		 309 aa  144  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 		 309 aa  142  8e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  29.87 
 
 		 308 aa  139  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  34.06 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.19 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.04 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.26 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.64 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.35 
 
 		 309 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.28 
 
 		 310 aa  135  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  29.61 
 
 		 329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 		 309 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  33.99 
 
 		 302 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.04 
 
 		 310 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 		 310 aa  132  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.6 
 
 		 306 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.04 
 
 		 310 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  31.78 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 		 316 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  31.06 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 		 327 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.46 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.9 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1830  UDP-glucose 4-epimerase  31.51 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0561  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.71 
 
 		 321 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6507  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  31.51 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0119  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  32.28 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.19 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 		 314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  30.4 
 
 		 332 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 		 353 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1962  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.36 
 
 		 326 aa  125  7e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.87 
 
 		 321 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.21 
 
 		 331 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  32.62 
 
 		 332 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.45 
 
 		 312 aa  125  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0563  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.34 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.95 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.06 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  31.69 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1402  UDP-galactose 4-epimerase  29.81 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.59 
 
 		 331 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  34.96 
 
 		 321 aa  124  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  30.3 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.8 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  30.37 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>