More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_3019 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
321 aa  656    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.97 
 
 
309 aa  427  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.52 
 
 
310 aa  391  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.76 
 
 
319 aa  275  5e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  46.28 
 
 
316 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.52 
 
 
319 aa  267  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.23 
 
 
308 aa  267  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.83 
 
 
317 aa  255  8e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.13 
 
 
310 aa  255  8e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43 
 
 
313 aa  248  8e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  42.38 
 
 
308 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.36 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 
310 aa  243  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.9 
 
 
317 aa  241  2e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  38.31 
 
 
312 aa  212  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.83 
 
 
313 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.67 
 
 
311 aa  196  6e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.4 
 
 
306 aa  192  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 
324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.78 
 
 
314 aa  185  7e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.13 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
311 aa  183  3e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.85 
 
 
301 aa  181  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.56 
 
 
325 aa  179  8e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  34.08 
 
 
317 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
311 aa  169  7e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.69 
 
 
313 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.67 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
317 aa  149  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
325 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
292 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
292 aa  124  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
315 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
296 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
310 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  34.73 
 
 
308 aa  122  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.07 
 
 
309 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  122  8e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 
292 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.6 
 
 
304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.68 
 
 
309 aa  117  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  28.71 
 
 
307 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
310 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.23 
 
 
353 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.31 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.73 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.37 
 
 
309 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
306 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
328 aa  112  9e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  30.36 
 
 
319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.21 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.08 
 
 
310 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  30.27 
 
 
330 aa  110  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  30.27 
 
 
331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  31.08 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
309 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
310 aa  110  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
328 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  27.65 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
328 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.05 
 
 
298 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0678  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  31.53 
 
 
309 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
320 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.11 
 
 
318 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 
309 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.99 
 
 
322 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
310 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
308 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
305 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
315 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
320 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000773597 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1733  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
324 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
323 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  29.13 
 
 
328 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.92 
 
 
312 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.94 
 
 
312 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
310 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  30.08 
 
 
302 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1228  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.75 
 
 
325 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
328 aa  104  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  28.21 
 
 
330 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  28.21 
 
 
330 aa  105  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.6 
 
 
325 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
304 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
324 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5789  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.16 
 
 
331 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0435819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.65 
 
 
313 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
310 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1573  UDP-galactose 4-epimerase  26.07 
 
 
328 aa  103  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.52654e-16 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.66 
 
 
310 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>