More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1772 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
301 aa  613  9.999999999999999e-175  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  88.33 
 
 
308 aa  554  1e-157  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  76.53 
 
 
311 aa  456  1e-127  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.35 
 
 
312 aa  439  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.35 
 
 
314 aa  424  1e-117  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.24 
 
 
325 aa  315  8e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.46 
 
 
315 aa  293  2e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.64 
 
 
311 aa  290  2e-77  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.28 
 
 
317 aa  256  3e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.23 
 
 
319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  44.23 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  43.17 
 
 
319 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.63 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.5 
 
 
310 aa  232  7.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  43.67 
 
 
308 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.04 
 
 
311 aa  230  2e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.37 
 
 
306 aa  226  3e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 
310 aa  226  4e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.19 
 
 
313 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.95 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.99 
 
 
313 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.06 
 
 
308 aa  211  9e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
309 aa  211  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  40.95 
 
 
312 aa  211  2e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  36.01 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.89 
 
 
324 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 
313 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.88 
 
 
333 aa  179  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  34.85 
 
 
302 aa  176  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.52 
 
 
321 aa  175  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
309 aa  172  9e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.2 
 
 
309 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.51 
 
 
309 aa  170  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 
311 aa  169  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.39 
 
 
310 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.12 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.23 
 
 
306 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.38 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.77 
 
 
309 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.29 
 
 
303 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
328 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.36 
 
 
305 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.54 
 
 
313 aa  158  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
313 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
324 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.31 
 
 
329 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
327 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  34.97 
 
 
328 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33 
 
 
292 aa  156  4e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.95 
 
 
313 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.91 
 
 
296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
302 aa  155  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
310 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.92 
 
 
310 aa  155  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.09 
 
 
344 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  34.09 
 
 
345 aa  154  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2205  UDP-glucose 4-epimerase  33.64 
 
 
327 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.81 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.24 
 
 
292 aa  152  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  33.23 
 
 
330 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  33.23 
 
 
331 aa  151  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 
310 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.42 
 
 
306 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.9 
 
 
310 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  35.48 
 
 
328 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.84 
 
 
311 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.22 
 
 
310 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  30.72 
 
 
307 aa  149  7e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.3 
 
 
325 aa  149  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 
318 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.23 
 
 
292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  36.27 
 
 
350 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.35 
 
 
330 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0255  UDP-glucose 4-epimerase  34.39 
 
 
344 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.97 
 
 
314 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
316 aa  145  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 
328 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
312 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0368  UDP-glucose 4-epimerase  31.46 
 
 
323 aa  145  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
328 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0227  UDP-glucose 4-epimerase  34.39 
 
 
344 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1505  dTDP-glucose 4-6-dehydratase  33.65 
 
 
331 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0339  UDP-galactose 4-epimerase  30.79 
 
 
331 aa  143  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  33.64 
 
 
326 aa  143  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1993  UDP-galactose 4-epimerase  31.93 
 
 
327 aa  143  4e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101551  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1806  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 
330 aa  142  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.217645 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
314 aa  142  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1175  UDP-glucose 4-epimerase  34.2 
 
 
330 aa  142  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.81 
 
 
317 aa  142  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1465  UDP-glucose 4-epimerase  33.54 
 
 
323 aa  142  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000880176  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.17 
 
 
318 aa  142  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.43 
 
 
315 aa  142  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
311 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
319 aa  142  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  32.67 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6416  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
323 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955033  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
324 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690036  normal  0.179961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1984  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.86 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>