More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1143 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
311 aa  629  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.387741  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.61 
 
 
306 aa  373  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.10516  normal  0.125028 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.02 
 
 
311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0885  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.97 
 
 
312 aa  266  5e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.91 
 
 
315 aa  265  7e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.113189  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.95 
 
 
314 aa  262  6.999999999999999e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.661925  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.55 
 
 
325 aa  251  9.000000000000001e-66  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.197237 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0489  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.67 
 
 
311 aa  251  1e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000122092 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0280  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.73 
 
 
319 aa  250  3e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 
317 aa  247  2e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0677  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.23 
 
 
310 aa  240  2e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.851073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0837  hypothetical protein  41.31 
 
 
308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0448  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.23 
 
 
308 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  42.58 
 
 
319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2024  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.8 
 
 
317 aa  232  6e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0133215  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0036  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  41.67 
 
 
316 aa  229  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0174817 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.41 
 
 
308 aa  224  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0575797  normal  0.628375 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0703  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.1 
 
 
310 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0958657  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1772  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.04 
 
 
301 aa  219  5e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.29 
 
 
313 aa  217  2e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.250586  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.36 
 
 
309 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.91 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.949606  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 
313 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.14 
 
 
312 aa  187  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3019  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.34 
 
 
321 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1334  UDP-glucose 4-epimerase  36.79 
 
 
317 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.297801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3975  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
324 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5470  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.25 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
317 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
310 aa  160  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
309 aa  151  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
309 aa  150  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  28.43 
 
 
344 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  28.43 
 
 
345 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
311 aa  142  8e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
305 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
317 aa  139  7e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.74 
 
 
303 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.16 
 
 
324 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
311 aa  136  4e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
315 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.15 
 
 
328 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.9 
 
 
318 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.38 
 
 
322 aa  135  8e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.31 
 
 
313 aa  135  9e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
310 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
292 aa  133  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
333 aa  132  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
306 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  29.84 
 
 
302 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 
306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  27.94 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
304 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 
310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 
310 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.42 
 
 
302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 
312 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.91 
 
 
325 aa  129  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.35 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  29.36 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.43 
 
 
299 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
310 aa  126  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43376  predicted protein  33.02 
 
 
326 aa  125  7e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412352  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
313 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1352  UDP-glucose 4-epimerase  31.13 
 
 
329 aa  125  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
309 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  30.91 
 
 
354 aa  125  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  29.87 
 
 
328 aa  124  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.45 
 
 
314 aa  123  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.72 
 
 
331 aa  123  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 
292 aa  122  6e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.06 
 
 
308 aa  122  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  29.56 
 
 
328 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.7 
 
 
313 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5023  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.9 
 
 
316 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.81 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1178  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0253268  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  29.9 
 
 
328 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
318 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.18 
 
 
314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1064  UDP-glucose 4-epimerase  30.28 
 
 
328 aa  120  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.89 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.31 
 
 
324 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  29.87 
 
 
328 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
313 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.22 
 
 
312 aa  119  7.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.28 
 
 
328 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0778  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.65 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00475764  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.182018  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4903  UDP-glucose 4-epimerase  27.99 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.027411  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0340  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
321 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>