More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2762 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
339 aa  694    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.27 
 
 
373 aa  339  2.9999999999999998e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 
680 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2779  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.9 
 
 
367 aa  335  9e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.12 
 
 
352 aa  332  5e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.12 
 
 
352 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1270  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.43 
 
 
368 aa  332  8e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.329626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.82 
 
 
352 aa  330  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.17 
 
 
367 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3495  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.07 
 
 
369 aa  327  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437184  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.61 
 
 
363 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.973232  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.85 
 
 
669 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.51 
 
 
354 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0250  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.58 
 
 
363 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.216393  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.49 
 
 
341 aa  311  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.43 
 
 
685 aa  310  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.8 
 
 
354 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.13 
 
 
684 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0433  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.66 
 
 
364 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0770236  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.81 
 
 
672 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.53 
 
 
339 aa  301  1e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.21 
 
 
672 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4599  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.64 
 
 
339 aa  299  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.336676  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.75 
 
 
342 aa  299  5e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3786  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.83 
 
 
345 aa  296  4e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2077  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.06 
 
 
363 aa  290  2e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568981  hitchhiker  0.00613192 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0777  dNTP-hexose dehydratase/epimerase  45.43 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.955272  normal  0.0951081 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2428  CDP-paratose 2-epimerase  44.84 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  hitchhiker  0.000207654 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4298  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.38 
 
 
355 aa  262  6e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.942852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0520  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.08 
 
 
351 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.75 
 
 
342 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.28 
 
 
306 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.73 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 
309 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.32 
 
 
309 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 
313 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.73 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.72 
 
 
317 aa  163  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.83 
 
 
303 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3699  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.5 
 
 
353 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.682682  normal  0.543496 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.92 
 
 
314 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
335 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
302 aa  160  4e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.08 
 
 
360 aa  159  7e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0627905  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.25 
 
 
325 aa  159  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.51 
 
 
358 aa  159  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.707519  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.32 
 
 
334 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.65 
 
 
327 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1768  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.58 
 
 
352 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.000159776  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2871  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.46 
 
 
352 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0630235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.82 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2646  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.34 
 
 
355 aa  156  6e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
310 aa  156  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
313 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3986  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 
354 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  33.03 
 
 
326 aa  155  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.18 
 
 
307 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
311 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3530  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
358 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.229301 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4115  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.09 
 
 
346 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560376  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4399  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
353 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
335 aa  149  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 
353 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659255 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
309 aa  149  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2121  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.28 
 
 
345 aa  149  7e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.147251  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.64 
 
 
292 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 
310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.54 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3352  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.19 
 
 
355 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.133016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.53 
 
 
310 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  32.34 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
310 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.97 
 
 
310 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.15 
 
 
350 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.646368 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.13 
 
 
330 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  33.23 
 
 
318 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
321 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.61 
 
 
348 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
313 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
304 aa  144  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.83 
 
 
296 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2106  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.81 
 
 
350 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0474818  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0050  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.71 
 
 
351 aa  144  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  32.84 
 
 
310 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  35.41 
 
 
353 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
328 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.62 
 
 
316 aa  142  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
337 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  30.79 
 
 
319 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1560  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.33 
 
 
354 aa  142  9e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
331 aa  142  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.91 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>