More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2145 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 304 aa  622  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.23 
 
 		 310 aa  279  4e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.55 
 
 		 316 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.79 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  43.79 
 
 		 332 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.33 
 
 		 307 aa  268  1e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.53 
 
 		 315 aa  246  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.39 
 
 		 339 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.08 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 		 315 aa  198  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1255  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  37.54 
 
 		 325 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.410518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.18 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  38.28 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  38.61 
 
 		 315 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0303  UDP-glucose 4-epimerase, putative  38.28 
 
 		 314 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.58 
 
 		 345 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0338  UDP-glucose 4-epimerase  37.95 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.9 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.71 
 
 		 292 aa  188  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.25 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.312436  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.37 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.82 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.74 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.49 
 
 		 292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.03 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.11 
 
 		 318 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  32.67 
 
 		 302 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 		 325 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0263  UDP-glucose 4-epimerase, C-terminus  40.16 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.67 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 313 aa  166  6.9999999999999995e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 		 303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.07 
 
 		 330 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.77 
 
 		 299 aa  162  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 		 305 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 		 304 aa  158  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 		 322 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.64 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 		 327 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 		 308 aa  156  4e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.05 
 
 		 317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  32.71 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1410  UDP-glucose 4-epimerase  34.45 
 
 		 339 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.935662  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 		 321 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.11 
 
 		 314 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.89 
 
 		 321 aa  152  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4306  UDP-glucose 4-epimerase  34.76 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0064009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.78 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.09 
 
 		 328 aa  152  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  31.35 
 
 		 354 aa  151  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13665  UDP-glucose 4-epimerase galE1  33.23 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0159869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.72 
 
 		 307 aa  151  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3929  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.09 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.92 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.77 
 
 		 315 aa  149  6e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  34.05 
 
 		 320 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1662  UDP-glucose 4-epimerase  32.41 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4827  UDP-glucose 4-epimerase  32.1 
 
 		 329 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.321852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.35 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.13 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  31.78 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2493  UDP-glucose 4-epimerase  33.55 
 
 		 350 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  32.71 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8322  UDP-glucose 4-epimerase  33.76 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0940  UDP-glucose 4-epimerase  32.81 
 
 		 327 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  32.25 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.26 
 
 		 353 aa  145  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1957  UDP-galactose 4-epimerase  33.13 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.880811  normal  0.626313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1166  UDP-glucose 4-epimerase  33.33 
 
 		 330 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 		 311 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  32.11 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  32.11 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4141  UDP-glucose 4-epimerase  33.23 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4279  UDP-galactose 4-epimerase  32.62 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.277879  normal  0.0248708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3289  UDP-glucose 4-epimerase  30.46 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 		 322 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  31.15 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>