More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0523 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 305 aa  633  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.54 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.77 
 
 		 310 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.29 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.42 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.53 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.86 
 
 		 332 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 		 316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  35.08 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.33 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.01 
 
 		 345 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.31 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.93 
 
 		 310 aa  168  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.312436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33900  UDP-glucose 4-epimerase  33.44 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  29.55 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1255  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  32.67 
 
 		 325 aa  156  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.410518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 315 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 		 310 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0303  UDP-glucose 4-epimerase, putative  28.16 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.08 
 
 		 335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  28.34 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0338  UDP-glucose 4-epimerase  28.16 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.13 
 
 		 310 aa  142  5e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 		 292 aa  142  8e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.29 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.2 
 
 		 304 aa  139  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.17 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.93 
 
 		 311 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.1 
 
 		 309 aa  135  8e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.64 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1848  UDP-glucose 4-epimerase  31.21 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  28.75 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 		 314 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0910  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  31.02 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  30.82 
 
 		 302 aa  132  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  30.28 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1030  UDP-glucose 4-epimerase  30.06 
 
 		 335 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1066  UDP-glucose 4-epimerase  29.75 
 
 		 335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0920176  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.38 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  30.28 
 
 		 336 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0263  UDP-glucose 4-epimerase, C-terminus  27.98 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 324 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1081  UDP-glucose 4-epimerase  30.41 
 
 		 321 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000142619  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 308 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000799266 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  33.23 
 
 		 319 aa  129  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2932  UDP-glucose 4-epimerase  28.18 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000357428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.71 
 
 		 306 aa  129  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 310 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2886  UDP-galactose-4-epimerase  29.46 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.632321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0576  UDP-glucose 4-epimerase  27.38 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.85 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20680  UDP-glucose 4-epimerase  29.6 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.34 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1324  UDP-glucose 4-epimerase  29.15 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1555  UDP-glucose 4-epimerase  29.15 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.37 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.211774  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  29.1 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.72 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0418  UDP-glucose 4-epimerase  29.56 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 		 310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0537  UDP-glucose 4-epimerase  28.75 
 
 		 328 aa  126  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4409  UDP-glucose 4-epimerase  30.99 
 
 		 316 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  28.3 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.73 
 
 		 315 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2149  UDP-glucose 4-epimerase  28.4 
 
 		 335 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  29.45 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.21 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3929  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0279  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 		 285 aa  125  1e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5388  UDP-glucose 4-epimerase  28.44 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2916  UDP-glucose 4-epimerase  29.91 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.660815 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  28.75 
 
 		 323 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.54 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0360193  hitchhiker  0.000175953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1173  UDP-galactose-4-epimerase  28.66 
 
 		 338 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.15 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3721  putative epimerase/dehydratase  27.89 
 
 		 384 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  29.65 
 
 		 593 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1369  UDP-glucose 4-epimerase  26.71 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5423  UDP-glucose 4-epimerase  30.35 
 
 		 328 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0946684  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.05 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2136  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.87 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0794715  normal  0.286988 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1797  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  28.45 
 
 		 338 aa  123  4e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2783  UDP-galactose 4-epimerase  27.88 
 
 		 337 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0966218  hitchhiker  0.000208277 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.19 
 
 		 331 aa  122  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0648845  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1384  UDP-glucose 4-epimerase  27.36 
 
 		 337 aa  122  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 		 313 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 		 331 aa  122  7e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.216355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>