More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1797 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1797  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  100 
 
 		 338 aa  707    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  74.02 
 
 		 346 aa  519  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0861  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  71.73 
 
 		 337 aa  515  1.0000000000000001e-145  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.18378  hitchhiker  0.0000000578516 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0304  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  64.69 
 
 		 345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.92366  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1064  hypothetical protein  60.24 
 
 		 337 aa  433  1e-120  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.732456 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0795  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  56.46 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0682  dTDP-glucose 4,6-dehydratase protein  56.8 
 
 		 354 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0824  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  56.76 
 
 		 359 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2139  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.91 
 
 		 356 aa  388  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1469  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 397 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.793194  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3383  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.16 
 
 		 338 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2319  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.69 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.251448 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6255  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.27 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.849165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0712  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.19 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2100  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.32 
 
 		 357 aa  386  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0761  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.72 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3727  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.19 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1714  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.19 
 
 		 353 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6417  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.16 
 
 		 338 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6250  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.46 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.030258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0878  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.19 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0640  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.29 
 
 		 353 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.151017 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6652  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.46 
 
 		 338 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2596  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.09 
 
 		 353 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1785  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.02 
 
 		 366 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1852  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.677884  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1990  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0338476  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0923  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3163  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3969  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.38 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00429727  normal  0.623158 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3105  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 353 aa  381  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.311481  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3803  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.98 
 
 		 350 aa  381  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  59.16 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2753  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 400 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.419146  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0619  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 		 355 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.129356 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3141  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.89 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2593  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.31 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.42 
 
 		 352 aa  376  1e-103  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1780  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.8 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.629198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.08 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0773  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.38 
 
 		 358 aa  375  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.781884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0419  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3072  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.36 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.611799  normal  0.380858 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2008  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  58.08 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0503  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.93 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0802438  normal  0.0327306 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.38 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03169  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.38 
 
 		 351 aa  376  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1318  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.52 
 
 		 359 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0342732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2719  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.42 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.719616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.38 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0939  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.12 
 
 		 348 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0926  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.43 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770588  normal  0.575373 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1618  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.26 
 
 		 359 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2473  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.82 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2653  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.25 
 
 		 360 aa  371  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13118  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 		 350 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399683  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0264  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.33 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.850535  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1489  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.82 
 
 		 355 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0715  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.46 
 
 		 353 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2890  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  55.72 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.19 
 
 		 360 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2735  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.98 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0512  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.5 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2317  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.39 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150256 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.47 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2222  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.01 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0048625  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0277  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.33 
 
 		 352 aa  368  1e-101  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.674919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3611  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.41 
 
 		 350 aa  369  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2540  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.36 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3035  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.52 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2631  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.1 
 
 		 360 aa  368  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4138  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  57.45 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000244942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15920  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.86 
 
 		 351 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5900  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  54.95 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3994  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.6 
 
 		 355 aa  368  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0537  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.42 
 
 		 353 aa  370  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.433038  normal  0.0400591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3122  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  56.42 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1379  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.65 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000705991 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2330  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.01 
 
 		 361 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.129575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3554  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.5 
 
 		 355 aa  369  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.110317  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.42 
 
 		 362 aa  364  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.793551  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1282  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.72 
 
 		 357 aa  367  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.306583  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2279  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.01 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000978054 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0354  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0120  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  53.75 
 
 		 353 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1237  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.56 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2639  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.56 
 
 		 356 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.997652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0516  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.71 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6725  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.24 
 
 		 353 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00991  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.87 
 
 		 360 aa  368  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2437  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  54.01 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000861453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1401  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.55 
 
 		 365 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0069994 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2895  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.05 
 
 		 351 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105937 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68170  dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase  54.65 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0640014  decreased coverage  0.00283529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3030  dTDP-glucose 4,6 dehydratase  53.49 
 
 		 359 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.179842 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3491  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  55.06 
 
 		 354 aa  367  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370229 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0186  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.76 
 
 		 355 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0574  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  52.27 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.389781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1749  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  54.49 
 
 		 354 aa  365  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>