More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55575 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_55575  nad-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 593 aa  1229    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34716  nad-dependent epimerase/dehydratase  67.89 
 
 		 397 aa  508  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26862  nad-dependent epimerase/dehydratase  68.48 
 
 		 408 aa  498  1e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.095088  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  47.38 
 
 		 323 aa  310  5e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4436  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 		 324 aa  296  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.57 
 
 		 326 aa  296  8e-79  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.579724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 330 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0897  hypothetical protein  47.4 
 
 		 337 aa  295  1e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0859871  hitchhiker  0.00490701 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.71 
 
 		 335 aa  294  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.251302  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3095  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.67 
 
 		 342 aa  294  3e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.89 
 
 		 326 aa  293  4e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2330  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.87 
 
 		 336 aa  293  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0894  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.51 
 
 		 349 aa  293  6e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.11 
 
 		 335 aa  293  8e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.46 
 
 		 337 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0656  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.01 
 
 		 335 aa  292  1e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0496  UDP-glucuronate 5'-epimerase  46.18 
 
 		 325 aa  291  2e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0876322  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3926  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.79 
 
 		 327 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.506298  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.42 
 
 		 324 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3879  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.09 
 
 		 327 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3930  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.21 
 
 		 335 aa  289  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2678  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 335 aa  289  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000277993  hitchhiker  0.00000000000000308835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47 
 
 		 324 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.31 
 
 		 336 aa  288  2e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47 
 
 		 324 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1792  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.22 
 
 		 353 aa  287  5e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.32 
 
 		 342 aa  286  5e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.11 
 
 		 335 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2598  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.66 
 
 		 358 aa  286  7e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1467  nucleoside-diphosphate-sugar epimerases  45.81 
 
 		 336 aa  286  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.23 
 
 		 322 aa  286  8e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0412  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.71 
 
 		 319 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.79 
 
 		 324 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2449  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  45.81 
 
 		 336 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0862725  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.35 
 
 		 336 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0418526  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0141  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.98 
 
 		 318 aa  283  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445777 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0618  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.67 
 
 		 341 aa  283  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.300865  normal  0.221889 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0191  putative nucleotide sugar epimerase  43.03 
 
 		 339 aa  282  1e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.068357  normal  0.128971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1509  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.88 
 
 		 336 aa  282  1e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5106  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.3 
 
 		 331 aa  281  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.41 
 
 		 336 aa  281  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1011  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.91 
 
 		 335 aa  280  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 		 330 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0909  UDP-N-acetylglucosamine 4-epimerase  43.54 
 
 		 339 aa  280  4e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.71 
 
 		 337 aa  280  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 		 346 aa  280  6e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0492299  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  44.21 
 
 		 337 aa  280  7e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1106  capsular polysaccharide biosynthesis protein  43.54 
 
 		 334 aa  279  8e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2850  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.44 
 
 		 335 aa  279  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0966  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.91 
 
 		 340 aa  279  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.91 
 
 		 341 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2116  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.31 
 
 		 335 aa  278  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.83 
 
 		 336 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.758145 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3260  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.69 
 
 		 337 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.07 
 
 		 337 aa  277  4e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.681243  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2499  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.73 
 
 		 337 aa  277  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3886  UDP-glucuronate 5'-epimerase  45.05 
 
 		 335 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3979  UDP-glucuronate 5'-epimerase  45.65 
 
 		 335 aa  276  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1374  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.41 
 
 		 337 aa  276  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.91 
 
 		 335 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13971  putative nucleotide sugar epimerase  44.57 
 
 		 342 aa  276  7e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0982  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.55 
 
 		 357 aa  276  8e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000156201 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25381  putative nucleotide sugar epimerase  41.84 
 
 		 340 aa  276  8e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.785313 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1400  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  44.81 
 
 		 337 aa  276  9e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.598011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05410  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.27 
 
 		 373 aa  276  9e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.411668  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0689  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.06 
 
 		 341 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2324  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.88 
 
 		 335 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.14 
 
 		 335 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0468  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  42.77 
 
 		 352 aa  275  2.0000000000000002e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.208737  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1588  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.88 
 
 		 336 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.31 
 
 		 336 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0618  oligopeptide transporter OPT  43.15 
 
 		 335 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0179  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.48 
 
 		 335 aa  275  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.293333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.05 
 
 		 335 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5586  capsular polysaccharide biosynthesis protein  45.06 
 
 		 332 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.31 
 
 		 336 aa  273  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4686  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  43.84 
 
 		 335 aa  273  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0229  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.88 
 
 		 339 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0115301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1760  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.98 
 
 		 333 aa  273  9e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.165697  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  43.06 
 
 		 352 aa  272  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.216313  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2241  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  44.18 
 
 		 336 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1080  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.4 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0892  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.34 
 
 		 324 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2638  UDP-glucuronate 5'-epimerase  43.94 
 
 		 336 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01321  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  41.92 
 
 		 338 aa  270  4e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0070  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.14 
 
 		 335 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.77 
 
 		 341 aa  270  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0430992  normal  0.16765 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.97 
 
 		 343 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1204  NAD dependent epimerase/dehydratase family  42.34 
 
 		 334 aa  270  7e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.573318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4274  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.18 
 
 		 335 aa  270  8e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0223  putative nucleotide sugar epimerase  42.14 
 
 		 340 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4269  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.51 
 
 		 317 aa  269  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4196  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.03 
 
 		 373 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2699  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  43.33 
 
 		 336 aa  268  2e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.96 
 
 		 323 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.362508 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.92 
 
 		 332 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.94 
 
 		 317 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3576  UDP-glucuronate 5'-epimerase  43.03 
 
 		 335 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12841  putative nucleotide sugar epimerase  40.71 
 
 		 345 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.363741  normal  0.0780964 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1074  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.51 
 
 		 339 aa  267  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.626876  normal  0.709829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>