More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3929 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3929  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
310 aa  634    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  34.3 
 
 
332 aa  186  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.81 
 
 
332 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.46 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.66 
 
 
315 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
304 aa  161  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
310 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.48 
 
 
339 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.53 
 
 
302 aa  143  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 
314 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
319 aa  143  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.312436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
313 aa  135  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
335 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.62 
 
 
311 aa  135  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
307 aa  135  9e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.99 
 
 
310 aa  132  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.3 
 
 
345 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.74 
 
 
309 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
296 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
309 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
310 aa  126  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.34 
 
 
306 aa  126  6e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.63 
 
 
305 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.49 
 
 
308 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  30.49 
 
 
302 aa  122  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.04 
 
 
292 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1255  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.84 
 
 
325 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.410518  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.27 
 
 
313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.93 
 
 
318 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  29.07 
 
 
315 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.06 
 
 
306 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1516  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
320 aa  119  7.999999999999999e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  28.38 
 
 
314 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1390  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.18 
 
 
322 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000137645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.43 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0338  UDP-glucose 4-epimerase  28.96 
 
 
314 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
305 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.25 
 
 
315 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.51 
 
 
330 aa  116  5e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.37 
 
 
292 aa  116  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0303  UDP-glucose 4-epimerase, putative  29.45 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.32 
 
 
314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1538  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.67 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00186226  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.97 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.71 
 
 
292 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0501  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
310 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95493  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0256  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.54 
 
 
334 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00101554  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.1 
 
 
307 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1391  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.35 
 
 
314 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.07 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.81 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 
310 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.466316  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.96 
 
 
344 aa  110  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.69 
 
 
325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 
310 aa  109  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.38 
 
 
307 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.52 
 
 
308 aa  108  1e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0554  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.06 
 
 
310 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.108773 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0608  UDP-glucose 4-epimerase  27.16 
 
 
324 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000293819  hitchhiker  0.00261597 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.5 
 
 
330 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.74 
 
 
339 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2187  UDP-galactose 4-epimerase  27.88 
 
 
327 aa  106  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.39 
 
 
343 aa  106  5e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.213871 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.85 
 
 
312 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3465  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.27 
 
 
360 aa  106  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.848345  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
680 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0186  UDP-galactose 4-epimerase  26.49 
 
 
354 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.95 
 
 
354 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0752  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.74 
 
 
360 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.16 
 
 
322 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1033  putative epimerase  32.39 
 
 
309 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24 
 
 
315 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0734  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  24.12 
 
 
335 aa  104  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.290638  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2404  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.64 
 
 
323 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.672695  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0769  UDP-glucose 4-epimerase  27.87 
 
 
329 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.953207  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33729  putative NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.75 
 
 
360 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000109637  normal 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28493  predicted protein  26.75 
 
 
360 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000203706  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3935  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.51 
 
 
358 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
328 aa  103  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11260  putative epimerase  32.86 
 
 
309 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.12 
 
 
328 aa  103  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4202  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.04 
 
 
355 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1685  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.8 
 
 
342 aa  102  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0260  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.5 
 
 
327 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0842  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.13 
 
 
353 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0136971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0389  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.13 
 
 
353 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0871  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  27.13 
 
 
353 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.83298  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
309 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1405  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.44 
 
 
354 aa  102  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3237  UDP-glucose 4-epimerase  27.44 
 
 
328 aa  101  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.218159  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4058  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  25.15 
 
 
358 aa  102  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.51 
 
 
309 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0380  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.06 
 
 
312 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2084  UDP-glucose 4-epimerase  26.32 
 
 
328 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0751  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  26.22 
 
 
353 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.143791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>