More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1187 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1187  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
335 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.86 
 
 
339 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.443287 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.91 
 
 
310 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2404  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.28 
 
 
307 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.78 
 
 
316 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325743  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.67 
 
 
304 aa  225  7e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.365657  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3445  glutamine amidotransferase  38.06 
 
 
332 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.210367 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.59 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6713  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.66 
 
 
314 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0954433  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4198  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 
345 aa  182  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
315 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 
309 aa  180  4e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1255  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.78 
 
 
325 aa  177  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.410518  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.42 
 
 
309 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0323  UDP-glucose 4-epimerase  30.13 
 
 
315 aa  173  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.428855  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0257  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.62 
 
 
315 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0338  UDP-glucose 4-epimerase  29.17 
 
 
314 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0303  UDP-glucose 4-epimerase, putative  29.17 
 
 
314 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0155  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.69 
 
 
310 aa  169  9e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.609306  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0308  UDP-glucose 4-epimerase  29.49 
 
 
314 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.5 
 
 
310 aa  166  8e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.89 
 
 
308 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0006  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.22 
 
 
319 aa  159  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.312436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  32.67 
 
 
302 aa  159  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3706  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.48 
 
 
317 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.336095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0523  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.94 
 
 
305 aa  153  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0145  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.49 
 
 
311 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0263  UDP-glucose 4-epimerase, C-terminus  30.62 
 
 
257 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0415  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.83 
 
 
292 aa  149  8e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.060465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 
302 aa  149  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.7 
 
 
335 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.28 
 
 
335 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3113  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.45 
 
 
306 aa  146  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
337 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5461  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.44 
 
 
330 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
310 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 
296 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
306 aa  144  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
334 aa  140  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1954  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.82 
 
 
310 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  31.38 
 
 
327 aa  138  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2010  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.52 
 
 
310 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1577  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
292 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.87 
 
 
303 aa  138  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.81 
 
 
292 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.6 
 
 
309 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.21 
 
 
318 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0337048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1925  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.19 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.239382  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
325 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3929  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.63 
 
 
310 aa  135  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5315  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.2 
 
 
309 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.57 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.87 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
353 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1446  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.26 
 
 
311 aa  132  6e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000127468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3795  UDP-glucose 4-epimerase  31.8 
 
 
353 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.67 
 
 
316 aa  132  9e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.48 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 
305 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.27 
 
 
334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.245783 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13665  UDP-glucose 4-epimerase galE1  34.63 
 
 
314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0159869 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0963  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
330 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409004  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1293  UDP-glucose 4-epimerase  31.85 
 
 
336 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3899  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 
328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2242  UDP-glucose 4-epimerase  33.23 
 
 
334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.558956  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2190  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.79 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4002  UDP-glucose 4-epimerase  33.88 
 
 
327 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.271936  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.19 
 
 
331 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.556189  normal  0.226818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.52 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1225  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.04 
 
 
304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.4 
 
 
312 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.747333  normal  0.141884 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0971  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.07 
 
 
309 aa  126  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.55 
 
 
328 aa  125  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0673  UDP-galactose 4-epimerase  34.26 
 
 
337 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000299597 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.33 
 
 
322 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1065  UDP-glucose 4-epimerase  30.86 
 
 
336 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.319648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2617  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
313 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5674  UDP-galactose 4-epimerase  31.25 
 
 
337 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.304425 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.15 
 
 
331 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4331  UDP-glucose 4-epimerase  32.89 
 
 
327 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00663713  hitchhiker  0.0035738 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.21 
 
 
333 aa  123  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
313 aa  123  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0668  UDP-glucose 4-epimerase  32.68 
 
 
319 aa  122  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0718222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1427  UDP-glucose 4-epimerase  31.1 
 
 
337 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.60129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2597  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.01 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0834  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.37 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1463  UDP-glucose 4-epimerase  31.87 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.612123  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1597  UDP-glucose 4-epimerase  32.02 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.903427  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3924  UDP-glucuronic acid epimerase  26.9 
 
 
339 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0031  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.02 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.891219  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4181  UDP-glucose 4-epimerase  33.01 
 
 
332 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3874  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
306 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.481806  normal  0.682249 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1708  UDP-glucose 4-epimerase  34.2 
 
 
331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.380668  normal  0.432414 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 
316 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.228313 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1711  UDP-glucose 4-epimerase  30.53 
 
 
329 aa  119  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0857741  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
339 aa  119  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>