More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3365 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3365  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
335 aa  692    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.78 
 
 
334 aa  494  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.387989  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3869  NAD-dependent epimerase/dehydratase  71.78 
 
 
335 aa  494  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.629775  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2150  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.39 
 
 
337 aa  480  1e-134  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169098 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0671  UDP-glucose 4-epimerase  65.23 
 
 
327 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3899  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.27 
 
 
329 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0935  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.94 
 
 
288 aa  355  5e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.59 
 
 
333 aa  187  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.61 
 
 
327 aa  177  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.47 
 
 
328 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.9 
 
 
328 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1148  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000161478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.06 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1942  UDP-glucose 4-epimerase  33.01 
 
 
302 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1079  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
343 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.471078  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0122  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.52 
 
 
314 aa  159  6e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000109546 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.02 
 
 
328 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
314 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.21 
 
 
336 aa  158  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.150051  normal  0.64899 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0428  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
309 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000231351  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3108  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 
328 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1120  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.93 
 
 
352 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0108801  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0413  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
309 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968529  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1322  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
313 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.9 
 
 
329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1061  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.63 
 
 
352 aa  153  5e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.808093  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.09 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1189  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
352 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  31.94 
 
 
344 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  31.94 
 
 
345 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1969  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
310 aa  152  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3888  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.44 
 
 
373 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00197458  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.05 
 
 
304 aa  150  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1849  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
331 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.216355 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22780  Nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.55 
 
 
318 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.33 
 
 
339 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
310 aa  149  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1182  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.89 
 
 
322 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 
324 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0223  putative nucleotide sugar epimerase  32.94 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2132  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.31 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.491781  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.03 
 
 
326 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
316 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.06 
 
 
302 aa  146  5e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6423  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
346 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.544479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0861  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.15 
 
 
336 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0707  nucleotide sugar epimerase  31.61 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.15214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
314 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01011  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.48 
 
 
324 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2037  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 
299 aa  144  2e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0149  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.48 
 
 
313 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2382  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.95 
 
 
314 aa  144  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.62051  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.24 
 
 
672 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.94 
 
 
672 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.22 
 
 
336 aa  143  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
315 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0759  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.97 
 
 
311 aa  143  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0121716  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3217  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.63 
 
 
354 aa  142  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4825  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.25 
 
 
324 aa  142  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.52 
 
 
329 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0228  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.99 
 
 
310 aa  142  7e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.194906  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.53 
 
 
669 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 
680 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0342  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
292 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000414523 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3924  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.5 
 
 
329 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.228757  normal  0.0226045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.63 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0232  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.12 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3614  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.4 
 
 
329 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.34994  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.35 
 
 
326 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
377 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0162  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.17 
 
 
313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.53 
 
 
334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3000  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.45 
 
 
330 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2111  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.7 
 
 
335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6728  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.19 
 
 
379 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.51 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3579  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.36 
 
 
317 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1835  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.5 
 
 
335 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120118 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2921  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
303 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5641  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1535  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.98 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.579578  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1741  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.38 
 
 
342 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.194967  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6389  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.79 
 
 
349 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.257537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1182  capsular polysaccharide biosynthesis protein I  30.88 
 
 
337 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3403  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.38 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5517  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.16 
 
 
315 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.66 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
335 aa  139  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0160  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.83 
 
 
310 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0900  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.02 
 
 
326 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.425817  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3393  dTDP-glucose 4,6-dehydratase, NAD-dependent epimerase/dehydratase-related protein  31.02 
 
 
326 aa  139  7e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.229105  normal  0.0838562 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0243  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.52 
 
 
324 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0152558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4267  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
317 aa  139  7.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.307285  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0164  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.92 
 
 
326 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.476272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
685 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.82 
 
 
341 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>